289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1783 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 367 aa  733    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  99.46 
 
 		 367 aa  729    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  68.39 
 
 		 368 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  62.9 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  63.34 
 
 		 383 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  60.11 
 
 		 358 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  60.06 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  65.8 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  55.98 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  39.26 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  38.68 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  37.64 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  37.64 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  37.21 
 
 		 329 aa  169  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  31.86 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  31.96 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  32.85 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  32.85 
 
 		 327 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  30.49 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  30.9 
 
 		 843 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  31.53 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  31.23 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  31.53 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  33.04 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  26.23 
 
 		 359 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  24.59 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  24.5 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  23.76 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  27.79 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  26.45 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  28.1 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  28.07 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  25.23 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.4 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  25.4 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  28.96 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  36.67 
 
 		 313 aa  53.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4342  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.71 
 
 		 683 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.239319 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4232  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.71 
 
 		 683 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  41.77 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0030  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.76 
 
 		 665 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1197  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.19 
 
 		 678 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.415933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  48.89 
 
 		 647 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.76 
 
 		 665 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3207  hypothetical protein  42.31 
 
 		 678 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.519422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 510 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  51.11 
 
 		 472 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.06 
 
 		 681 aa  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3583  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 665 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2057  putative oxidoreductase  45.16 
 
 		 450 aa  49.7  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0749543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 665 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6036  putative oxidoreductase  50 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  44.12 
 
 		 670 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  51.11 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.27 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1362  putative oxidoreductase  44.44 
 
 		 445 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  45.28 
 
 		 493 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.89 
 
 		 493 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  46.67 
 
 		 647 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  46.67 
 
 		 647 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2156  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  36.36 
 
 		 667 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  45.83 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4152  glutamate synthase subunit beta  64.86 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.89 
 
 		 493 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  62.16 
 
 		 479 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  45.1 
 
 		 502 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0355  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.76 
 
 		 686 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.212693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  55.81 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  45.1 
 
 		 502 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  33.81 
 
 		 502 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  45.9 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3426  heterodisulfide reductase subunit  32.88 
 
 		 665 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  48.15 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  48.15 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  48.15 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  48.15 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  37.88 
 
 		 645 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>