50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1426 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  100 
 
 
362 aa  719    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  63.13 
 
 
347 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  66.25 
 
 
347 aa  429  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  57.06 
 
 
344 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 
336 aa  223  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
346 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 
335 aa  209  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  26.67 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 
328 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  26.39 
 
 
327 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  25 
 
 
328 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 
368 aa  85.9  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  25.38 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  25.69 
 
 
328 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.38 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  29.7 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  24.65 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  27.37 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  25.27 
 
 
843 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  26.46 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  26.3 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  27.12 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  25.63 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  23.94 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
314 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 
329 aa  63.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
367 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 
333 aa  63.2  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
330 aa  63.2  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
354 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  26.76 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1399  hypothetical protein  17.65 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  24.59 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  21.52 
 
 
389 aa  43.5  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>