12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1399 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1399  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  745    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128745  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00981  hypothetical protein  83.02 
 
 
371 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0926997  normal  0.536427 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1428  hypothetical protein  27.94 
 
 
381 aa  172  9e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.521801  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10711  hypothetical protein  31.75 
 
 
388 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10691  hypothetical protein  29.74 
 
 
386 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.97155  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0996  hypothetical protein  31.84 
 
 
388 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10711  hypothetical protein  30.87 
 
 
388 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1689  hypothetical protein  28.42 
 
 
388 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03531  GMC oxidoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G01770)  40.91 
 
 
555 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  22.16 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>