17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1428 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1428  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  764    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.521801  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1689  hypothetical protein  54.74 
 
 		 388 aa  355  6.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0996  hypothetical protein  28.42 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10711  hypothetical protein  27.48 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00981  hypothetical protein  30.42 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0926997  normal  0.536427 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10691  hypothetical protein  25.65 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.97155  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1399  hypothetical protein  27.94 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128745  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10711  hypothetical protein  28.35 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  25.9 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 314 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 328 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  31.18 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  25.81 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>