17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0996 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0996  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  778    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10711  hypothetical protein  76.29 
 
 
388 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10711  hypothetical protein  76.55 
 
 
388 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10691  hypothetical protein  53.98 
 
 
386 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.97155  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1428  hypothetical protein  28.42 
 
 
381 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.521801  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1689  hypothetical protein  28.94 
 
 
388 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1399  hypothetical protein  31.84 
 
 
369 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128745  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00981  hypothetical protein  31.07 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0926997  normal  0.536427 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  20.15 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  19.44 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  19.69 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  20.05 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  21.73 
 
 
333 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  18.26 
 
 
339 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  21.76 
 
 
361 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  19.34 
 
 
323 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 
330 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>