45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0167 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
336 aa  674    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  43.73 
 
 
335 aa  276  4e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 
344 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  43.99 
 
 
347 aa  239  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  42.72 
 
 
362 aa  230  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  42.41 
 
 
347 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
346 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
344 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  25.36 
 
 
843 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 
346 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  27.95 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  27.14 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  27.48 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  26.24 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
367 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
367 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  25 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  25.81 
 
 
344 aa  53.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  22.44 
 
 
359 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  25 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 
368 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
407 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  25.57 
 
 
381 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  25.85 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  24.71 
 
 
327 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  47.37 
 
 
474 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  43.55 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5617  flavin-containing amine oxidase  35.96 
 
 
432 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  47.37 
 
 
492 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  24.43 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 
361 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  24.46 
 
 
328 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  52 
 
 
413 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>