111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0783 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  98.48 
 
 		 328 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  98.48 
 
 		 328 aa  663    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 328 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  95.43 
 
 		 328 aa  627  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  74.31 
 
 		 327 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  74.31 
 
 		 327 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  74.62 
 
 		 328 aa  511  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  72.87 
 
 		 328 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  75.84 
 
 		 328 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  73.48 
 
 		 328 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  66.87 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  39.14 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  42.46 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  36.96 
 
 		 329 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  40.06 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  35.73 
 
 		 843 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  37.98 
 
 		 324 aa  185  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 383 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  36.58 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  36.88 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  35.1 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  33.83 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 407 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 367 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 360 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  33.44 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  30.3 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  28.48 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  31.58 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.23 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.61 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  29.34 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  30.28 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  28.39 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  30.84 
 
 		 348 aa  92.8  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  28.14 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  24.64 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 346 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.05 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.38 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  25.8 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  25.18 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  25 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  25.51 
 
 		 484 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 344 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  34.74 
 
 		 421 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  42.86 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  30.21 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  41.38 
 
 		 436 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  48.15 
 
 		 537 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  40 
 
 		 502 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  40 
 
 		 502 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  33.04 
 
 		 463 aa  46.6  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1428  hypothetical protein  28.93 
 
 		 381 aa  46.2  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.521801  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  35.38 
 
 		 435 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  42.86 
 
 		 492 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  42.19 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  31.65 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  43.64 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  31.65 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  31.65 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  24.29 
 
 		 468 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  31.37 
 
 		 445 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  24.29 
 
 		 468 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  51.02 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  24.29 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  28.12 
 
 		 482 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  43.64 
 
 		 493 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  44.44 
 
 		 479 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  31.71 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  29.2 
 
 		 469 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  35.21 
 
 		 456 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  38.1 
 
 		 466 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  38.1 
 
 		 466 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  36.92 
 
 		 465 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1579  UDP-galactopyranose mutase  30.93 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  41.51 
 
 		 482 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  46 
 
 		 435 aa  42.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  41.51 
 
 		 490 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8301  D-nopaline dehydrogenase  42.86 
 
 		 464 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.909485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>