87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4120 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  100 
 
 		 348 aa  670    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  48.02 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  44.97 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  43.03 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  42.09 
 
 		 381 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  40.96 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  32.66 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  31.59 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  31.87 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  30.06 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  30.34 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  30.34 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  29.04 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  28.82 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  29.64 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  25.27 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  29.1 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  29.11 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  29.53 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  29.43 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  28.33 
 
 		 843 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  28.82 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  29 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  46.38 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  41.18 
 
 		 445 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  41.27 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  50 
 
 		 552 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  50 
 
 		 498 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  45.28 
 
 		 438 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  51.16 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  44.83 
 
 		 543 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  32 
 
 		 484 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 642 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  41.33 
 
 		 628 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 642 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  31.71 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  44.07 
 
 		 508 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  50.85 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  45.16 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  35.63 
 
 		 556 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  26.75 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  44.19 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  44.19 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  40.82 
 
 		 490 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  40.82 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  36.71 
 
 		 436 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  40.82 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  28.57 
 
 		 647 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  40.82 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  40.82 
 
 		 490 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  25.63 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  40.82 
 
 		 485 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  40.82 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  44.44 
 
 		 490 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  28.57 
 
 		 647 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  23.91 
 
 		 647 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  40.54 
 
 		 427 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  43.18 
 
 		 434 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  40.82 
 
 		 487 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  42.22 
 
 		 487 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>