102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1735 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  83.39 
 
 
313 aa  481  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  47.48 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  52.09 
 
 
316 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  48.23 
 
 
319 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  44.97 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  31.21 
 
 
328 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  30.24 
 
 
327 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  29.34 
 
 
327 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  30.53 
 
 
328 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  30.22 
 
 
328 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
354 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 
346 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
328 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  29.79 
 
 
328 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  29.94 
 
 
324 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  26.69 
 
 
359 aa  99  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  29.85 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 
333 aa  96.3  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
341 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
330 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
407 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 
313 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  29.63 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
351 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  28.44 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  28.48 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  27.22 
 
 
843 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  31.06 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  30.21 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  48.72 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
367 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
367 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  27.46 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  40.86 
 
 
451 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  27.3 
 
 
355 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  46.3 
 
 
445 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  24.24 
 
 
353 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  51.85 
 
 
445 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  39.71 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
335 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  34.81 
 
 
448 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
344 aa  49.3  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  56.41 
 
 
647 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  56.41 
 
 
647 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  56.41 
 
 
645 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  47.92 
 
 
435 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  44.12 
 
 
418 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  42.86 
 
 
470 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  48.15 
 
 
435 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  40 
 
 
436 aa  46.6  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  51.28 
 
 
647 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  44.74 
 
 
447 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  36.73 
 
 
425 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  40.3 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  44.78 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  28.27 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  28.77 
 
 
438 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  46.94 
 
 
642 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  51.85 
 
 
450 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  46.94 
 
 
642 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  51.85 
 
 
450 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 
510 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  45.21 
 
 
456 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  45.76 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  41.38 
 
 
498 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  41.43 
 
 
543 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  37.5 
 
 
502 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  37.5 
 
 
502 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  38.75 
 
 
456 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  25.63 
 
 
403 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  39.66 
 
 
435 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  26.67 
 
 
361 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  42.59 
 
 
479 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  29.17 
 
 
492 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  46.27 
 
 
504 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  36.92 
 
 
469 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  28.12 
 
 
552 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  44.07 
 
 
426 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  49.09 
 
 
459 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2662  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  40.74 
 
 
658 aa  42.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>