64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0825 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  55.41 
 
 		 319 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  53.85 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  54.46 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  52.09 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  47.72 
 
 		 348 aa  228  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  29.82 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  29.61 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  29.52 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  26.55 
 
 		 359 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  28.92 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 338 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  28.7 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  33.43 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  30.7 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  29.02 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  30.06 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  29.71 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  30 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  29.09 
 
 		 843 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  29.63 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  28.61 
 
 		 355 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  27.41 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  26.11 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 407 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  26.59 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  33.77 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  32.53 
 
 		 523 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  29.25 
 
 		 484 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  41.67 
 
 		 434 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  46.15 
 
 		 435 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  50 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  37.88 
 
 		 445 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  25.63 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  35.21 
 
 		 431 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  39.71 
 
 		 628 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  32.14 
 
 		 435 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>