273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3031 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
369 aa  721    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  63.39 
 
 
367 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  63.93 
 
 
367 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  66.48 
 
 
368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  63.56 
 
 
351 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  65.31 
 
 
383 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  59.34 
 
 
358 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  61.56 
 
 
360 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  58.74 
 
 
407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 
314 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  37.01 
 
 
355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  37.78 
 
 
332 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  37.21 
 
 
324 aa  159  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  35.71 
 
 
329 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 
341 aa  156  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  36.39 
 
 
343 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  33.43 
 
 
344 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  35.57 
 
 
330 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  33.05 
 
 
354 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  33.33 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 
328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  34.2 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  31.88 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  31.59 
 
 
327 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  31.67 
 
 
843 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  30.75 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  29.31 
 
 
328 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
339 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  29.31 
 
 
328 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 
329 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
333 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  31.7 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  27.4 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.32 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  23.29 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  31.2 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  32.47 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  28.68 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  28.16 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.31 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  27.68 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
346 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 
342 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
342 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
342 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  37.8 
 
 
316 aa  60.1  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  28.62 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  27.84 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  27.78 
 
 
347 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  26.4 
 
 
523 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  34.94 
 
 
624 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  41.07 
 
 
478 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  42.31 
 
 
478 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  25.12 
 
 
353 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  43.06 
 
 
436 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  41.07 
 
 
474 aa  50.4  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  47.83 
 
 
491 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  31.9 
 
 
485 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  31.9 
 
 
490 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  47.5 
 
 
599 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  30.41 
 
 
560 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  56.1 
 
 
479 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  30.41 
 
 
560 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  41.07 
 
 
472 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  34.62 
 
 
494 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  29.68 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  31.03 
 
 
490 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  31.03 
 
 
482 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  31.03 
 
 
487 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  51.28 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  41.07 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  31.03 
 
 
482 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.32 
 
 
475 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  51.28 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  39.29 
 
 
479 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0661  FAD dependent dehydrogenase  44.44 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  31.03 
 
 
482 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  37.5 
 
 
472 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  43.94 
 
 
670 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2156  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  36.36 
 
 
667 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4019  putative oxidoreductase  58.54 
 
 
448 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  51.22 
 
 
482 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  47.37 
 
 
487 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  31.58 
 
 
487 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  38.46 
 
 
482 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  40 
 
 
479 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  46.55 
 
 
532 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  48.84 
 
 
463 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  49.09 
 
 
490 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  56.1 
 
 
455 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>