More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2613 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  100 
 
 		 403 aa  828    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  40.1 
 
 		 407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  37.98 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  40.92 
 
 		 409 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  40.35 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  39.09 
 
 		 420 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  40 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  38.83 
 
 		 420 aa  269  5e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  38.46 
 
 		 418 aa  269  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  38.17 
 
 		 414 aa  266  7e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  38.35 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  38.35 
 
 		 414 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  39.32 
 
 		 415 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  39.46 
 
 		 418 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  37.31 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  36.73 
 
 		 414 aa  256  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  39.04 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  38.72 
 
 		 420 aa  254  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  37.5 
 
 		 408 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  37.82 
 
 		 420 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  38.07 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  37.53 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  40.94 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  39.31 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  37.99 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  37.82 
 
 		 419 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  36.25 
 
 		 404 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  36.5 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  39.5 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  35.25 
 
 		 404 aa  236  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  35.24 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  35.09 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  36.83 
 
 		 421 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  36.04 
 
 		 404 aa  229  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  36.07 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  35.79 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  32.67 
 
 		 400 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  38.26 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  32.51 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  36.19 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  34.59 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  35.88 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  36.13 
 
 		 417 aa  212  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  33.67 
 
 		 424 aa  209  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  35.89 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  37.56 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  32.79 
 
 		 460 aa  202  6e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  36.41 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  36.8 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  35.01 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  32.07 
 
 		 402 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  31.9 
 
 		 388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  30.63 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  30.56 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  31.28 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  32.19 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  33.81 
 
 		 346 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  32.7 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  26.39 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  31.6 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.63 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  29 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.9 
 
 		 445 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  26.43 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  27.24 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  31.75 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  27.88 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  26.03 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  29.81 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.47 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19500  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  26.04 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  28.74 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.08 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  27.25 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 324 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  30.66 
 
 		 344 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  29.61 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  29.17 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  28.14 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  28.77 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  30.43 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.64 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  28.09 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  28.29 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.89 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  27.15 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  29 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1999  phosphofructokinase  26.24 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  31.13 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  23.4 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.03 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  28.52 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  25.87 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  28.79 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  26.46 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  22.51 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.87 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  28.02 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>