More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2318 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  78.57 
 
 
421 aa  679    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  100 
 
 
422 aa  861    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  70.17 
 
 
419 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  59.51 
 
 
421 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  57.8 
 
 
420 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  57.28 
 
 
420 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  54.39 
 
 
414 aa  482  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  54.63 
 
 
414 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  55.53 
 
 
419 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  53.61 
 
 
419 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  54.92 
 
 
420 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  56.63 
 
 
419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  54.22 
 
 
421 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  52.68 
 
 
420 aa  465  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  52.68 
 
 
420 aa  466  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  52.05 
 
 
418 aa  458  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  58.01 
 
 
418 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  53.27 
 
 
418 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  48.32 
 
 
429 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  52.22 
 
 
418 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  47.98 
 
 
424 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  51.36 
 
 
417 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  51.36 
 
 
427 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  44.36 
 
 
407 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  45.58 
 
 
415 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  42.65 
 
 
415 aa  324  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  42.82 
 
 
394 aa  324  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  44.39 
 
 
422 aa  322  9.000000000000001e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  49 
 
 
417 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  46.37 
 
 
409 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  41.09 
 
 
414 aa  309  5e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  40.54 
 
 
418 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  42.05 
 
 
415 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  38.59 
 
 
414 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  38.52 
 
 
408 aa  269  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  38 
 
 
400 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  37.75 
 
 
400 aa  265  8e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  37.93 
 
 
404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  36.41 
 
 
403 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  35.4 
 
 
447 aa  238  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  37.12 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  37.29 
 
 
404 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  37.34 
 
 
404 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  36.39 
 
 
404 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  37.23 
 
 
406 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  30.8 
 
 
460 aa  209  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  36.48 
 
 
402 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  33.66 
 
 
404 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  35.38 
 
 
405 aa  196  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  33 
 
 
406 aa  190  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  36.39 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  33.94 
 
 
402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  31.57 
 
 
388 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  27.7 
 
 
340 aa  116  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  29.28 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  31.07 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.81 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  29.81 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.29 
 
 
341 aa  110  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  27.75 
 
 
343 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  29.41 
 
 
341 aa  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  30.89 
 
 
344 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  31.23 
 
 
340 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  29.58 
 
 
341 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  32.01 
 
 
370 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  32.01 
 
 
342 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  31.15 
 
 
341 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  29.17 
 
 
365 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  29.74 
 
 
343 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  30.48 
 
 
342 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  32.19 
 
 
341 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  33.65 
 
 
367 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  30.77 
 
 
342 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  31.64 
 
 
366 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  33.75 
 
 
341 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  29.57 
 
 
343 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  30 
 
 
344 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  29.93 
 
 
373 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  29.41 
 
 
346 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  31.6 
 
 
341 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  34.12 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  27.51 
 
 
364 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  34.74 
 
 
341 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  29.45 
 
 
372 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  32.96 
 
 
363 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  30.12 
 
 
360 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  30.48 
 
 
345 aa  97.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  29.25 
 
 
343 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  29.25 
 
 
343 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  29.86 
 
 
343 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  29.25 
 
 
343 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  33.49 
 
 
359 aa  97.1  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  30.4 
 
 
342 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  29.02 
 
 
350 aa  96.3  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  32.54 
 
 
368 aa  96.3  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 
350 aa  96.3  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.57 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  30.06 
 
 
365 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  31.6 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.4 
 
 
461 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>