More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0806 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  100 
 
 
394 aa  807    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  71.65 
 
 
422 aa  574  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  58.94 
 
 
407 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  50.62 
 
 
420 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  49.5 
 
 
419 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  49.01 
 
 
418 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  49.63 
 
 
421 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  49.13 
 
 
420 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  49.5 
 
 
420 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  48.76 
 
 
419 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  47.63 
 
 
420 aa  378  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  47.63 
 
 
420 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  48.26 
 
 
421 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  48.76 
 
 
419 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  47.49 
 
 
414 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  47.49 
 
 
414 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  48.76 
 
 
418 aa  344  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  46.77 
 
 
429 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  48 
 
 
417 aa  338  7e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  48.01 
 
 
418 aa  338  7e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  48 
 
 
427 aa  338  8e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  46.58 
 
 
409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  43.97 
 
 
421 aa  318  9e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  43.03 
 
 
414 aa  315  8e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  44.89 
 
 
415 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  45.09 
 
 
419 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  43.35 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  44.72 
 
 
418 aa  306  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  41.9 
 
 
424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  41.87 
 
 
415 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  41.87 
 
 
408 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  40.15 
 
 
418 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  43.03 
 
 
422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  43.07 
 
 
417 aa  279  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  41.09 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  39.45 
 
 
400 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  39.45 
 
 
400 aa  265  8e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  39.34 
 
 
404 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  39.31 
 
 
403 aa  246  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  34.87 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  33.1 
 
 
460 aa  218  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  39.18 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  39.33 
 
 
403 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  35.71 
 
 
406 aa  208  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  37.56 
 
 
404 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  36.62 
 
 
406 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  37.53 
 
 
404 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  37.18 
 
 
404 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  37.38 
 
 
404 aa  199  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  34.88 
 
 
405 aa  192  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  31 
 
 
378 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  35.67 
 
 
402 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  32.07 
 
 
346 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  32.05 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  31.74 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  29.31 
 
 
341 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  29.17 
 
 
360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  32.14 
 
 
370 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  28.25 
 
 
341 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  28.3 
 
 
340 aa  123  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  31.49 
 
 
344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  29.09 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  30.19 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  31.05 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  30.5 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  28.22 
 
 
341 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  28.45 
 
 
341 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  29.72 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  29.44 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  28.78 
 
 
373 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  27.42 
 
 
341 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  27.84 
 
 
341 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  28.81 
 
 
346 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  28.35 
 
 
365 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  33.97 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
336 aa  109  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  26.12 
 
 
344 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  27.92 
 
 
319 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  32.94 
 
 
368 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  32.56 
 
 
362 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  30.27 
 
 
342 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0642  6-phosphofructokinase  27.68 
 
 
333 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  30.61 
 
 
342 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  27.64 
 
 
319 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  26.2 
 
 
340 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  26.44 
 
 
335 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.56 
 
 
461 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  30.6 
 
 
342 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  27.61 
 
 
368 aa  103  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  27.87 
 
 
364 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  28.52 
 
 
340 aa  102  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  26.59 
 
 
341 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  31.06 
 
 
356 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  29.09 
 
 
319 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  29.03 
 
 
359 aa  100  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  29.09 
 
 
319 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  32.88 
 
 
439 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  29.54 
 
 
359 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  30.47 
 
 
363 aa  99.8  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  31.33 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>