More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2244 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  100 
 
 		 342 aa  668    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  69.39 
 
 		 343 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  68.51 
 
 		 343 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  68.51 
 
 		 343 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  68.51 
 
 		 343 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  68.8 
 
 		 343 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  67.35 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  65.89 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  61.7 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  61.11 
 
 		 341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  61.81 
 
 		 342 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  61.4 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  60.53 
 
 		 341 aa  401  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  59.94 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  59.65 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  60.82 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  59.94 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  59.94 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  60.23 
 
 		 341 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  60.53 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  59.36 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  58.48 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  59.36 
 
 		 342 aa  371  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  53.37 
 
 		 348 aa  340  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  55.49 
 
 		 344 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  51.98 
 
 		 341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  52.77 
 
 		 340 aa  325  6e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  48.68 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  48.97 
 
 		 340 aa  315  5e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  54.12 
 
 		 343 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  50.3 
 
 		 343 aa  314  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  50.15 
 
 		 370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  48.68 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  50.88 
 
 		 368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  49.56 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  50.58 
 
 		 341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  48.54 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  48.97 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  48.54 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  46.36 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  49.56 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  48.25 
 
 		 344 aa  299  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  52.54 
 
 		 375 aa  299  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  47.52 
 
 		 344 aa  298  6e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  49.42 
 
 		 360 aa  298  7e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  47.89 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  46.06 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  47.49 
 
 		 370 aa  295  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  46.49 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  43.86 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  47.79 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  48.41 
 
 		 345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  51.01 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  48.27 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  44.23 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  47.71 
 
 		 372 aa  285  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  45.59 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  48.57 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  45.7 
 
 		 358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  45.32 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  49.27 
 
 		 351 aa  279  5e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  45.38 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  44.38 
 
 		 359 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  42.4 
 
 		 346 aa  272  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  45.03 
 
 		 364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  45.21 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  46.2 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  43.66 
 
 		 361 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  46.85 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  45.1 
 
 		 378 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  45.69 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  45.95 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  45.11 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 350 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 350 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  43.03 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  43.84 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  42.18 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  43.29 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  40.24 
 
 		 322 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  39.77 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  42.48 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  41.67 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  42.42 
 
 		 319 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  41.28 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  43.27 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  41.89 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  42.07 
 
 		 319 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  42.68 
 
 		 319 aa  235  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  41.52 
 
 		 322 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  40.72 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  40.48 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  41.94 
 
 		 322 aa  233  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  40.49 
 
 		 320 aa  232  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  41.28 
 
 		 320 aa  232  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  41.28 
 
 		 320 aa  232  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  41.28 
 
 		 320 aa  232  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  41.28 
 
 		 320 aa  232  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>