More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1798 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 358 aa  718    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  59.94 
 
 		 368 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  59.39 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  56.94 
 
 		 364 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  55.92 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  56.51 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  54.14 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  53.44 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  52.89 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  52.65 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  52.21 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  51.1 
 
 		 363 aa  358  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  48.75 
 
 		 368 aa  348  1e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  48.9 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  52.34 
 
 		 363 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  49.18 
 
 		 372 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  49.18 
 
 		 372 aa  332  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  52.68 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  51.4 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  50.55 
 
 		 361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  48.48 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  50.7 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  50.14 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  49.16 
 
 		 375 aa  327  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  51.04 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  52.08 
 
 		 341 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  48.6 
 
 		 362 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  51.34 
 
 		 342 aa  322  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  50.29 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  51.04 
 
 		 341 aa  318  9e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  51.19 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  50.6 
 
 		 341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  46.8 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  50.54 
 
 		 368 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  47.79 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  49.04 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  50.15 
 
 		 341 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  50.3 
 
 		 342 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  48.6 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  49.27 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  50.3 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  48.92 
 
 		 369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  48.66 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  46.45 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  46.58 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  45.58 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  46.5 
 
 		 350 aa  295  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  46.84 
 
 		 340 aa  295  7e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  46.5 
 
 		 350 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  46.26 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  48.21 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  45.92 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  47.58 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  47.18 
 
 		 346 aa  291  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  44.06 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  47.52 
 
 		 341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  48.66 
 
 		 340 aa  288  8e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  46.04 
 
 		 345 aa  283  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  48.2 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  47.81 
 
 		 345 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  44.02 
 
 		 349 aa  271  9e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  49.11 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  43.79 
 
 		 343 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  43.2 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  45.7 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  47.38 
 
 		 344 aa  263  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  43.03 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  43.03 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  43.03 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3044  6-phosphofructokinase  43.9 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  47.98 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  42.9 
 
 		 343 aa  259  7e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  44.25 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  44.09 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  46.73 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  41.62 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  45.83 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  43.32 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  41.11 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  41.18 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  39.53 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  42.14 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  39.54 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  39.14 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  40.59 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  39.44 
 
 		 327 aa  228  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0592  6-phosphofructokinase  39.73 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00575817  normal  0.643142 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  39.64 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  40.44 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  40.44 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  40.88 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  40.29 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2041  6-phosphofructokinase  40.77 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>