More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0062 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  100 
 
 
344 aa  695    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  52.89 
 
 
349 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  54.09 
 
 
348 aa  364  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  53.82 
 
 
344 aa  359  4e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  55.52 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  55.52 
 
 
341 aa  354  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  53.49 
 
 
341 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  55.23 
 
 
341 aa  352  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  55.23 
 
 
341 aa  350  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  54.07 
 
 
342 aa  349  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  54.07 
 
 
346 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  53.2 
 
 
342 aa  346  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  53.64 
 
 
340 aa  345  7e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  53.78 
 
 
341 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  52.33 
 
 
342 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.02 
 
 
346 aa  331  9e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  52.33 
 
 
341 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  50.58 
 
 
341 aa  328  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  53.03 
 
 
341 aa  328  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  53.89 
 
 
342 aa  328  9e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  46.96 
 
 
345 aa  311  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  49.57 
 
 
341 aa  309  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  48.41 
 
 
343 aa  309  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  51.18 
 
 
342 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  48.12 
 
 
343 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  51.58 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  47.54 
 
 
345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  47.98 
 
 
373 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  48.41 
 
 
340 aa  300  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  47.09 
 
 
343 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  46.96 
 
 
343 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  46.96 
 
 
343 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  46.96 
 
 
343 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  47.65 
 
 
370 aa  298  7e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  46.67 
 
 
363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  46.97 
 
 
344 aa  289  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  46.39 
 
 
340 aa  288  9e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  46.47 
 
 
368 aa  288  9e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  47.09 
 
 
364 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  47.52 
 
 
342 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  45.38 
 
 
363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  45.48 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  46.96 
 
 
342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  44.77 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  46.59 
 
 
351 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  45.09 
 
 
360 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  44.85 
 
 
341 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  44.64 
 
 
363 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  45.76 
 
 
341 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  44.51 
 
 
362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  46.11 
 
 
359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  47.01 
 
 
343 aa  272  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  45.95 
 
 
366 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  45.82 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  45.8 
 
 
339 aa  270  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  44.89 
 
 
370 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  42.98 
 
 
343 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  44.48 
 
 
365 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  44.38 
 
 
375 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  44.22 
 
 
364 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  44.41 
 
 
359 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  43.28 
 
 
372 aa  258  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  44.25 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  42.94 
 
 
362 aa  252  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  43.52 
 
 
361 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  42.99 
 
 
336 aa  251  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  43.86 
 
 
367 aa  249  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  43.59 
 
 
372 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  42.26 
 
 
365 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  42.74 
 
 
372 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  39.47 
 
 
332 aa  245  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  43.39 
 
 
356 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  44.07 
 
 
368 aa  243  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  40.29 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  38.87 
 
 
319 aa  239  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  39.88 
 
 
360 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  40.88 
 
 
319 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  38.87 
 
 
319 aa  237  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  39.7 
 
 
322 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  37.72 
 
 
321 aa  232  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  37.91 
 
 
322 aa  233  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  41.74 
 
 
360 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  37.8 
 
 
322 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  41.74 
 
 
360 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  38.82 
 
 
319 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 
319 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 
319 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 
319 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 
319 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 
319 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 
319 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  38.78 
 
 
320 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 
319 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 
319 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  39.41 
 
 
319 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  37.91 
 
 
319 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  40.92 
 
 
350 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  40 
 
 
378 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  36.31 
 
 
319 aa  226  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>