More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08980 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  100 
 
 
340 aa  671    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  65.5 
 
 
341 aa  447  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  64.22 
 
 
344 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  64.33 
 
 
341 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  61.83 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  60.82 
 
 
341 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  60.82 
 
 
341 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  61.7 
 
 
346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  59.94 
 
 
341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  61.11 
 
 
342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  59.36 
 
 
341 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  60.64 
 
 
342 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  59.65 
 
 
341 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  61.11 
 
 
341 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  60.53 
 
 
342 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  59.36 
 
 
342 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  59.06 
 
 
342 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  57.6 
 
 
341 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  61.11 
 
 
340 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  59.36 
 
 
341 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  57.31 
 
 
341 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  55.56 
 
 
344 aa  355  5e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  52.49 
 
 
348 aa  340  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  55.26 
 
 
343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  52.91 
 
 
343 aa  329  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  53.04 
 
 
345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  52.33 
 
 
343 aa  325  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  50.72 
 
 
349 aa  323  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  52.46 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  52.46 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  52.46 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  51.74 
 
 
343 aa  317  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  50 
 
 
345 aa  308  8e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  52.77 
 
 
342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  48.51 
 
 
341 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  48.41 
 
 
344 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  50.58 
 
 
365 aa  299  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  51.33 
 
 
373 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  47.95 
 
 
364 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  47.21 
 
 
341 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  48.26 
 
 
343 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  49.71 
 
 
360 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  49.85 
 
 
368 aa  292  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  47.41 
 
 
340 aa  292  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  47.95 
 
 
359 aa  290  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  45.76 
 
 
368 aa  290  3e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  49.12 
 
 
370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  48.66 
 
 
358 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  45.93 
 
 
346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  46.18 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  48.8 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  47.54 
 
 
370 aa  281  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  48.12 
 
 
365 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  47.49 
 
 
363 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  43.9 
 
 
366 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  51.64 
 
 
356 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  45.76 
 
 
363 aa  275  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 
351 aa  275  7e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  43.9 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  47.99 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  44.71 
 
 
362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  48.13 
 
 
372 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  46.83 
 
 
342 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  47.52 
 
 
364 aa  272  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  46.67 
 
 
359 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  45.78 
 
 
372 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  46.53 
 
 
369 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  45.93 
 
 
361 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  48.1 
 
 
367 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  46.38 
 
 
368 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  47.34 
 
 
375 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  42.77 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  44.38 
 
 
360 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  40.12 
 
 
319 aa  248  9e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  39.82 
 
 
319 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  44.01 
 
 
365 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  40.36 
 
 
322 aa  246  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  42.77 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  45.05 
 
 
350 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  42.68 
 
 
336 aa  243  3e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  45.05 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  40.83 
 
 
324 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  43.54 
 
 
362 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  42.6 
 
 
326 aa  239  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  43.24 
 
 
366 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  43.65 
 
 
378 aa  236  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  45.16 
 
 
360 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  45.16 
 
 
360 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  38.64 
 
 
332 aa  235  7e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  39.53 
 
 
320 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  38.81 
 
 
320 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  39.53 
 
 
320 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  39.53 
 
 
320 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  38.42 
 
 
324 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  38.64 
 
 
335 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  38.05 
 
 
319 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  38.81 
 
 
320 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  40.36 
 
 
319 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  38.81 
 
 
320 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  38.81 
 
 
320 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>