More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0140 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 320 aa  651    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  99.38 
 
 		 320 aa  649    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  93.12 
 
 		 320 aa  608  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  92.81 
 
 		 320 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  87.5 
 
 		 320 aa  585  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  87.5 
 
 		 320 aa  577  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  86.25 
 
 		 320 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  86.25 
 
 		 320 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0171  6-phosphofructokinase  82.5 
 
 		 320 aa  549  1e-155  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  75.94 
 
 		 331 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  73.75 
 
 		 320 aa  502  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  73.12 
 
 		 320 aa  501  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0089  6-phosphofructokinase  77.06 
 
 		 327 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0088  6-phosphofructokinase  77.06 
 
 		 327 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4126  6-phosphofructokinase  76.76 
 
 		 327 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  72.5 
 
 		 320 aa  498  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  72.5 
 
 		 321 aa  490  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  66.88 
 
 		 320 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  66.56 
 
 		 320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  58 
 
 		 319 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  55.97 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  55.66 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  55.66 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  55.66 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  55.66 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  55.35 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  55.66 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  55.66 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  55.35 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  56.95 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  55.66 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  56.67 
 
 		 319 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  53.77 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  53.77 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  51.56 
 
 		 322 aa  332  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  52.82 
 
 		 319 aa  331  9e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  55.18 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0220  6-phosphofructokinase  51.4 
 
 		 326 aa  328  8e-89  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  55.45 
 
 		 340 aa  323  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl174  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 323 aa  319  5e-86  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1755  6-phosphofructokinase  48.75 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106028  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  48.75 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  47.71 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  51.32 
 
 		 339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  49.84 
 
 		 332 aa  305  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  50.83 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  51.32 
 
 		 322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  48.75 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  48.12 
 
 		 321 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  47.67 
 
 		 319 aa  294  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  49.02 
 
 		 324 aa  291  9e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  50.86 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  49.52 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  47.34 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  50.66 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  47.96 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  48.53 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0336  6-phosphofructokinase  48.28 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  48.31 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  49.21 
 
 		 331 aa  278  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  45.03 
 
 		 323 aa  276  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  46.6 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  51.24 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  47.71 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  44.77 
 
 		 319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  43.08 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  49.68 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  44.73 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  44.77 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  43.77 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  43.48 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0439  6-phosphofructokinase  47.39 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  42.55 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  43.46 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2041  6-phosphofructokinase  45.1 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  44.27 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  43.46 
 
 		 319 aa  259  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  41.85 
 
 		 344 aa  258  9e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  43.46 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  46.08 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  46.42 
 
 		 319 aa  255  7e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  41.93 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  45.85 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1738  6-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0448  6-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.76635  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 		 324 aa  252  7e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>