More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4275 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  100 
 
 
324 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3102  6-phosphofructokinase  83.33 
 
 
324 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000237495  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  63.78 
 
 
328 aa  431  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  61.3 
 
 
327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  59.57 
 
 
322 aa  385  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  57.06 
 
 
326 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  54.63 
 
 
326 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  56.79 
 
 
322 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  55.08 
 
 
328 aa  363  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  52.01 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0879  6-phosphofructokinase  52 
 
 
350 aa  350  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  53.09 
 
 
339 aa  347  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  52.78 
 
 
328 aa  347  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  51.23 
 
 
347 aa  345  6e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0033  6-phosphofructokinase  54.29 
 
 
327 aa  343  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  52.78 
 
 
336 aa  342  4e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  55.25 
 
 
320 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  52.78 
 
 
328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  50.59 
 
 
332 aa  332  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2597  6-phosphofructokinase  49.38 
 
 
344 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0115361  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  51.39 
 
 
323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  49.38 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0556  6-phosphofructokinase  52.96 
 
 
329 aa  326  3e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0367843  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  52.78 
 
 
319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  50.62 
 
 
320 aa  325  5e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  50.3 
 
 
331 aa  322  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2022  6-phosphofructokinase  48.61 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.761403  normal  0.299205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  50.93 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  50.31 
 
 
320 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  50 
 
 
319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  49.23 
 
 
326 aa  318  7.999999999999999e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  49.38 
 
 
321 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  52.78 
 
 
319 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  53.56 
 
 
324 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  49.69 
 
 
320 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  52.16 
 
 
319 aa  316  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  51.85 
 
 
319 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  51.85 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  51.85 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  51.85 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  51.85 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  51.85 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  51.85 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  51.85 
 
 
319 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  51.85 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  55.41 
 
 
339 aa  312  4.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0927  6-phosphofructokinase  49.08 
 
 
323 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.729181  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  54.61 
 
 
340 aa  311  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  47.99 
 
 
319 aa  310  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  52.82 
 
 
340 aa  308  5e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  49.38 
 
 
323 aa  309  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  47.68 
 
 
319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  48.92 
 
 
319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  49.69 
 
 
319 aa  308  8e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  50 
 
 
322 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  49.23 
 
 
335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  53.7 
 
 
319 aa  305  6e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  47.6 
 
 
324 aa  301  8.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  49.39 
 
 
322 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0439  6-phosphofructokinase  49.38 
 
 
320 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  46.91 
 
 
319 aa  299  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2592  6-phosphofructokinase  47.68 
 
 
323 aa  299  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  48.62 
 
 
324 aa  299  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  46.91 
 
 
319 aa  295  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  51.66 
 
 
322 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1755  6-phosphofructokinase  51.66 
 
 
322 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106028  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0448  6-phosphofructokinase  46.97 
 
 
332 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.76635  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1738  6-phosphofructokinase  46.97 
 
 
332 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  48.82 
 
 
321 aa  291  7e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  51.82 
 
 
319 aa  291  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  46.6 
 
 
319 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3024  6-phosphofructokinase  45.68 
 
 
328 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  46.13 
 
 
335 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  46.44 
 
 
319 aa  285  5e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  44.65 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  45.96 
 
 
322 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  45.34 
 
 
319 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0336  6-phosphofructokinase  47.87 
 
 
341 aa  277  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1769  6-phosphofructokinase  45.68 
 
 
319 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2448  6-phosphofructokinase  45.06 
 
 
319 aa  276  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  45.2 
 
 
321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  44.58 
 
 
319 aa  272  6e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2041  6-phosphofructokinase  47.22 
 
 
318 aa  272  7e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2519  6-phosphofructokinase  45.23 
 
 
320 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  44.58 
 
 
320 aa  271  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  45.45 
 
 
320 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 
331 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  45.2 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 
320 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 
320 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 
320 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 
320 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 
320 aa  266  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 
320 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 
320 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  46.75 
 
 
320 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 
320 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 
320 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  43.65 
 
 
320 aa  265  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  45.82 
 
 
320 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.415837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>