More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2511 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  100 
 
 
364 aa  734    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  70.83 
 
 
365 aa  518  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  58.42 
 
 
372 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  56.52 
 
 
372 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  56.04 
 
 
369 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  55.68 
 
 
370 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  52.51 
 
 
363 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  55.01 
 
 
368 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  54.29 
 
 
368 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  53.89 
 
 
359 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  54.04 
 
 
363 aa  358  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  51.8 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  52.65 
 
 
361 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  52.47 
 
 
362 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  51.51 
 
 
365 aa  348  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  53.46 
 
 
363 aa  347  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  51.37 
 
 
366 aa  342  7e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  51.37 
 
 
365 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  50.42 
 
 
363 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  50.96 
 
 
356 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  48.75 
 
 
360 aa  332  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  50.14 
 
 
373 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  46.87 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  49.45 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  48.61 
 
 
367 aa  317  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  46.56 
 
 
368 aa  312  5.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  47.79 
 
 
358 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  45.88 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  47.41 
 
 
360 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  47.41 
 
 
360 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  48.99 
 
 
341 aa  305  6e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  50.88 
 
 
341 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  50.58 
 
 
342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  50.44 
 
 
344 aa  300  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  48.13 
 
 
348 aa  299  5e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  45.6 
 
 
375 aa  295  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  49.28 
 
 
341 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  47.67 
 
 
340 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  49.42 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  46.13 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  47.83 
 
 
346 aa  282  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  44.72 
 
 
366 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  48.96 
 
 
341 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  46.22 
 
 
340 aa  279  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  43.01 
 
 
365 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  46.73 
 
 
342 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  47.38 
 
 
341 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  47.32 
 
 
342 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  46.78 
 
 
341 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  45.24 
 
 
343 aa  275  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  46.96 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  46.22 
 
 
345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  45.48 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  47.37 
 
 
341 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  47.52 
 
 
340 aa  272  7e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  48.56 
 
 
342 aa  272  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  45.13 
 
 
343 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  41.16 
 
 
350 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  41.94 
 
 
372 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  41.16 
 
 
350 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  45.54 
 
 
343 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  43.9 
 
 
343 aa  265  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  44.18 
 
 
343 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  44.18 
 
 
343 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  44.18 
 
 
343 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  44.22 
 
 
344 aa  261  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  44.68 
 
 
355 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  40.83 
 
 
362 aa  259  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  44.41 
 
 
345 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  44.87 
 
 
339 aa  258  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  42.98 
 
 
341 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  45.03 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  43.14 
 
 
346 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  46.51 
 
 
351 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  46.11 
 
 
341 aa  246  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  40.72 
 
 
390 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  44.48 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  43.7 
 
 
342 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  45.93 
 
 
342 aa  239  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3044  6-phosphofructokinase  41.18 
 
 
357 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0957436  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  43.3 
 
 
344 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  38.18 
 
 
378 aa  236  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  41.09 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1263  6-phosphofructokinase  35.85 
 
 
403 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  41.86 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  40.48 
 
 
319 aa  231  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  38.6 
 
 
319 aa  228  9e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  39.66 
 
 
326 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  38.71 
 
 
319 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  38.71 
 
 
319 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0592  6-phosphofructokinase  39.13 
 
 
360 aa  226  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00575817  normal  0.643142 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  38.3 
 
 
319 aa  225  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  39.77 
 
 
320 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  39.37 
 
 
335 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  40.7 
 
 
322 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  39.6 
 
 
324 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0439  6-phosphofructokinase  41.23 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  40.52 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  39.83 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  39.64 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>