More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1055 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  100 
 
 
320 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  67.81 
 
 
320 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  63.75 
 
 
320 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0439  6-phosphofructokinase  65.31 
 
 
320 aa  387  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  60.31 
 
 
319 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  60 
 
 
319 aa  381  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  57.01 
 
 
321 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  59.69 
 
 
319 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  54.82 
 
 
332 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  55.31 
 
 
319 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  59.06 
 
 
319 aa  364  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  58.75 
 
 
319 aa  363  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  58.75 
 
 
319 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  58.75 
 
 
319 aa  363  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  58.75 
 
 
319 aa  363  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  58.75 
 
 
319 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  58.75 
 
 
319 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  58.75 
 
 
319 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  58.44 
 
 
319 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  58.44 
 
 
319 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  54.23 
 
 
319 aa  351  8e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  54.23 
 
 
319 aa  351  8e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  59.87 
 
 
324 aa  347  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  54.69 
 
 
322 aa  341  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  60.62 
 
 
319 aa  341  8e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  51.72 
 
 
335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  51.86 
 
 
326 aa  333  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  50.47 
 
 
319 aa  332  4e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  53.12 
 
 
319 aa  330  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  51.55 
 
 
322 aa  328  5.0000000000000004e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  50.16 
 
 
319 aa  328  8e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  53.73 
 
 
322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  50.62 
 
 
324 aa  325  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  53.12 
 
 
323 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  51.08 
 
 
326 aa  322  4e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  50.31 
 
 
322 aa  321  9.000000000000001e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  51.1 
 
 
319 aa  321  9.000000000000001e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  50.16 
 
 
319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  50.31 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1755  6-phosphofructokinase  50.31 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  52.41 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  50.78 
 
 
336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  56.36 
 
 
340 aa  310  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3102  6-phosphofructokinase  50.31 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000237495  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2041  6-phosphofructokinase  54.37 
 
 
318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  49.07 
 
 
324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  49.54 
 
 
327 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  48.89 
 
 
319 aa  306  3e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  54.48 
 
 
340 aa  305  6e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  48.28 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  49.54 
 
 
328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  49.39 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  49.23 
 
 
328 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  50.33 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0927  6-phosphofructokinase  51.24 
 
 
323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.729181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  48.45 
 
 
320 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  47.22 
 
 
324 aa  299  4e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0556  6-phosphofructokinase  47.81 
 
 
329 aa  294  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0367843  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  47.6 
 
 
319 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  46.89 
 
 
328 aa  294  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 
320 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  46.25 
 
 
319 aa  288  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  46.3 
 
 
324 aa  287  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  45.31 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2597  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 
344 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0115361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  45.82 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0336  6-phosphofructokinase  47.19 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0033  6-phosphofructokinase  53.77 
 
 
327 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  45.62 
 
 
319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  45.77 
 
 
320 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  51.89 
 
 
339 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  45.17 
 
 
321 aa  278  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  47.68 
 
 
323 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  44.89 
 
 
339 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  46.23 
 
 
321 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  46.89 
 
 
320 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  45.25 
 
 
331 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  46.44 
 
 
322 aa  275  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0171  6-phosphofructokinase  45.25 
 
 
320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  45.57 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0448  6-phosphofructokinase  47.44 
 
 
332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.76635  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1738  6-phosphofructokinase  47.44 
 
 
332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  45.25 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  46.56 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  46.56 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  46.56 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2448  6-phosphofructokinase  49.13 
 
 
319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  46.56 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  46.56 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  44.94 
 
 
320 aa  272  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  45.57 
 
 
320 aa  272  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  45.9 
 
 
320 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  45.9 
 
 
320 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0879  6-phosphofructokinase  43.61 
 
 
350 aa  271  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  45.9 
 
 
320 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  45.9 
 
 
320 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  45.9 
 
 
320 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  45.9 
 
 
320 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1769  6-phosphofructokinase  49.83 
 
 
319 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>