More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1068 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  100 
 
 
347 aa  704    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  86.84 
 
 
339 aa  600  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2597  6-phosphofructokinase  89.94 
 
 
344 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0115361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  82.04 
 
 
324 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2022  6-phosphofructokinase  75.78 
 
 
340 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.761403  normal  0.299205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0879  6-phosphofructokinase  74.25 
 
 
350 aa  504  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  55.86 
 
 
327 aa  363  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  54.35 
 
 
326 aa  360  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  54.49 
 
 
322 aa  352  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  54.01 
 
 
322 aa  345  6e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  51.23 
 
 
324 aa  345  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  53.87 
 
 
328 aa  345  8e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  53.4 
 
 
328 aa  341  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  52.96 
 
 
326 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3102  6-phosphofructokinase  52.16 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000237495  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0033  6-phosphofructokinase  58.36 
 
 
327 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  50.31 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  51.08 
 
 
321 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  51.54 
 
 
326 aa  318  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  48.17 
 
 
328 aa  315  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  49.54 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  50.46 
 
 
319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0556  6-phosphofructokinase  48.93 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0367843  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  48.65 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  49.07 
 
 
319 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  49.07 
 
 
319 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 
319 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  51.39 
 
 
323 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  50.31 
 
 
319 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  50.31 
 
 
319 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3024  6-phosphofructokinase  48.62 
 
 
328 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  49.38 
 
 
319 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2592  6-phosphofructokinase  47.62 
 
 
323 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  50.15 
 
 
322 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  47.68 
 
 
319 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  47.68 
 
 
319 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  52.01 
 
 
319 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  50.15 
 
 
320 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 
319 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 
319 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  46.36 
 
 
335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  48.61 
 
 
319 aa  288  7e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  47.94 
 
 
319 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0927  6-phosphofructokinase  46.44 
 
 
323 aa  288  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.729181  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  47.85 
 
 
327 aa  285  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  46.46 
 
 
322 aa  285  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  46.95 
 
 
322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  49.2 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1755  6-phosphofructokinase  46.95 
 
 
322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106028  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  50.84 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  45.82 
 
 
320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  45.43 
 
 
335 aa  282  8.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  48.76 
 
 
324 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  46.89 
 
 
324 aa  277  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 
320 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  44.63 
 
 
324 aa  276  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  44.31 
 
 
331 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  45.87 
 
 
321 aa  275  9e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1738  6-phosphofructokinase  47 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0448  6-phosphofructokinase  47 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.76635  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  45.34 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  48 
 
 
340 aa  273  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  45.65 
 
 
319 aa  272  7e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  49 
 
 
339 aa  271  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0439  6-phosphofructokinase  47.68 
 
 
320 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0649  6-phosphofructokinase  43.71 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  43.34 
 
 
319 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0336  6-phosphofructokinase  46.6 
 
 
341 aa  268  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2041  6-phosphofructokinase  46.13 
 
 
318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  43.34 
 
 
319 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  43.34 
 
 
319 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  46.44 
 
 
320 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  42.99 
 
 
322 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  44.14 
 
 
321 aa  256  5e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  44.27 
 
 
320 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0088  6-phosphofructokinase  46.13 
 
 
327 aa  252  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0089  6-phosphofructokinase  46.13 
 
 
327 aa  252  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4126  6-phosphofructokinase  46.13 
 
 
327 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  45.87 
 
 
320 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  47.51 
 
 
331 aa  250  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 
320 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 
320 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 
320 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 
320 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 
320 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1769  6-phosphofructokinase  44.27 
 
 
319 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  46.98 
 
 
320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  46.03 
 
 
320 aa  245  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  43.96 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  44.58 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  44.58 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>