More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1461 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 324 aa  658    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2597  6-phosphofructokinase  82.92 
 
 		 344 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0115361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  82.04 
 
 		 347 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  81.37 
 
 		 339 aa  542  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0879  6-phosphofructokinase  78.64 
 
 		 350 aa  527  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2022  6-phosphofructokinase  75.16 
 
 		 340 aa  509  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.761403  normal  0.299205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  54.66 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  52.01 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  53.56 
 
 		 327 aa  348  6e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0033  6-phosphofructokinase  58.03 
 
 		 327 aa  345  8.999999999999999e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  53.27 
 
 		 322 aa  343  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  52.96 
 
 		 326 aa  342  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  51.7 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  52.52 
 
 		 328 aa  335  5e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3102  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 		 324 aa  335  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000237495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  49.23 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  50.47 
 
 		 322 aa  322  5e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0556  6-phosphofructokinase  48.29 
 
 		 329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0367843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  46.44 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  48.45 
 
 		 319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  48.49 
 
 		 332 aa  302  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  48.45 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  49.36 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  47.83 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  47.83 
 
 		 321 aa  298  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2592  6-phosphofructokinase  47.12 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  47.83 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  46.27 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  49.84 
 
 		 323 aa  291  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  47.2 
 
 		 319 aa  291  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  48.3 
 
 		 319 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  48.3 
 
 		 319 aa  288  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  46.89 
 
 		 319 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  47.2 
 
 		 319 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  46.3 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0927  6-phosphofructokinase  44.89 
 
 		 323 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.729181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  48.45 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  45.68 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  51.17 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  46.98 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  47.83 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  49.84 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  46.27 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  45.96 
 
 		 319 aa  278  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  45.96 
 
 		 319 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  45.96 
 
 		 319 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  45.96 
 
 		 319 aa  279  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  45.96 
 
 		 319 aa  279  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  45.96 
 
 		 319 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  45.96 
 
 		 319 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  45.96 
 
 		 319 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  45.96 
 
 		 319 aa  278  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  47.77 
 
 		 320 aa  277  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  47.2 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3024  6-phosphofructokinase  45.11 
 
 		 328 aa  275  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  45.82 
 
 		 319 aa  275  7e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 323 aa  275  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  46.28 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  46.25 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1755  6-phosphofructokinase  45.45 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106028  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  45.45 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0448  6-phosphofructokinase  47.68 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.76635  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1738  6-phosphofructokinase  47.68 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  42.55 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  47.67 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  44.89 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  46.84 
 
 		 319 aa  268  7e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0439  6-phosphofructokinase  47.04 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  48.41 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  46.58 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0649  6-phosphofructokinase  44.17 
 
 		 347 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  44.72 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  42.68 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  41.98 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  44.72 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  44.26 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 319 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  47.33 
 
 		 321 aa  260  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  48.99 
 
 		 331 aa  258  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  48.83 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  48.01 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  47.84 
 
 		 320 aa  255  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  43.03 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  48.66 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  48.66 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  48.66 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  48.66 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  48.66 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1769  6-phosphofructokinase  46.96 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  45.85 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  45.17 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  45.54 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  45.48 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  45.48 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  45.48 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  45.48 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  45.48 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  45.48 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>