More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0452 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 339 aa  685    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2597  6-phosphofructokinase  87.32 
 
 		 344 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0115361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  86.84 
 
 		 347 aa  600  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  81.37 
 
 		 324 aa  542  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2022  6-phosphofructokinase  74.85 
 
 		 340 aa  521  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.761403  normal  0.299205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0879  6-phosphofructokinase  77.47 
 
 		 350 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  57.41 
 
 		 327 aa  363  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  53.54 
 
 		 326 aa  358  7e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  54.49 
 
 		 322 aa  347  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  53.09 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  54.29 
 
 		 322 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  54.32 
 
 		 328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  53.56 
 
 		 328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  52.94 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0033  6-phosphofructokinase  59.15 
 
 		 327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3102  6-phosphofructokinase  52.47 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000237495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  51.24 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  48.46 
 
 		 328 aa  317  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0556  6-phosphofructokinase  49.38 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0367843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 		 319 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  49.27 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  49.7 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  50.46 
 
 		 319 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3024  6-phosphofructokinase  49.07 
 
 		 328 aa  301  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  50.46 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  48.92 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  50.15 
 
 		 319 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  50.62 
 
 		 322 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  49.54 
 
 		 319 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 		 323 aa  292  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2592  6-phosphofructokinase  47.45 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0927  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.729181  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  48.9 
 
 		 319 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  48.9 
 
 		 319 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  47.99 
 
 		 319 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  51.39 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  47.99 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  47.68 
 
 		 319 aa  285  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  47.68 
 
 		 319 aa  285  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  48.39 
 
 		 319 aa  286  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 		 320 aa  285  8e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  48.31 
 
 		 319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 		 319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 		 319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 		 319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 		 319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 		 319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 		 319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  47.37 
 
 		 319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  52.16 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  47.85 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  46.79 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  48.31 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 335 aa  277  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0649  6-phosphofructokinase  44.78 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  44.89 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  46.77 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  45.23 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  46.77 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1755  6-phosphofructokinase  45.73 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106028  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 		 319 aa  276  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  45.73 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  45.29 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1738  6-phosphofructokinase  47.51 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0448  6-phosphofructokinase  47.51 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.76635  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  44.98 
 
 		 324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0439  6-phosphofructokinase  47.68 
 
 		 320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  46.3 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  49.33 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  49.67 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  47.22 
 
 		 324 aa  271  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0336  6-phosphofructokinase  47.85 
 
 		 341 aa  269  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  43.96 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  45.9 
 
 		 319 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 319 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  45.9 
 
 		 319 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2041  6-phosphofructokinase  44.58 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  44.75 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  42.68 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  48.66 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  46.98 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0089  6-phosphofructokinase  47.19 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0088  6-phosphofructokinase  47.19 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4126  6-phosphofructokinase  47.19 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  46.56 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  45.82 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  46.49 
 
 		 320 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  46.82 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  45.82 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  47.49 
 
 		 320 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  47.49 
 
 		 320 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  47.49 
 
 		 320 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  47.49 
 
 		 320 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  47.49 
 
 		 320 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1769  6-phosphofructokinase  45.39 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  39.94 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2734  6-phosphofructokinase  42.58 
 
 		 741 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  44.44 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>