More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0649 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0649  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 347 aa  711    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01919  6-phosphofructokinase  46.08 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  46.25 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  44.78 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  44.38 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  43.71 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2597  6-phosphofructokinase  43.45 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0115361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  44.17 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  44.41 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0879  6-phosphofructokinase  43.88 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  45.2 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  43.85 
 
 		 322 aa  259  6e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  43.71 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  43.6 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  41.39 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2022  6-phosphofructokinase  41.95 
 
 		 340 aa  256  6e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.761403  normal  0.299205 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  44 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  43.64 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  44.05 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0556  6-phosphofructokinase  42.42 
 
 		 329 aa  252  7e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0367843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  41.42 
 
 		 327 aa  249  6e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  42.72 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  42.9 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  43.79 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1738  6-phosphofructokinase  45.05 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0448  6-phosphofructokinase  45.05 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.76635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0033  6-phosphofructokinase  44.24 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  42.9 
 
 		 319 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  42.59 
 
 		 319 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  44.98 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3024  6-phosphofructokinase  42.41 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  43.56 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  43.31 
 
 		 332 aa  242  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  43.16 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  43.25 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3102  6-phosphofructokinase  42.07 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000237495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  43.08 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  42.73 
 
 		 335 aa  238  8e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  41.85 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  43.03 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  41.85 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0336  6-phosphofructokinase  42.43 
 
 		 341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  39.88 
 
 		 328 aa  236  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  43.79 
 
 		 324 aa  235  8e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  42.38 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0927  6-phosphofructokinase  40 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.729181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  43.87 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  42.95 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  42.76 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  41.32 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1755  6-phosphofructokinase  41.32 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  45.57 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2041  6-phosphofructokinase  42.24 
 
 		 318 aa  229  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  41.59 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  43.32 
 
 		 340 aa  225  8e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  45.9 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  39.88 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  42.3 
 
 		 319 aa  225  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2592  6-phosphofructokinase  40.37 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  44.03 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  40.57 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  41.27 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  41.72 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  41.87 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  42.59 
 
 		 320 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  42.17 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  42.27 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  42.3 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  42.63 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  42.45 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  42.45 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  42.45 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  42.45 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  42.63 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  42.45 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  41.99 
 
 		 320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  42.99 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  38.34 
 
 		 335 aa  215  8e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  43.14 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  42.81 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>