More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1832 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  100 
 
 
341 aa  676    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  84.75 
 
 
341 aa  585  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  76.25 
 
 
341 aa  530  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  76.83 
 
 
341 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  75.95 
 
 
341 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  73.31 
 
 
341 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  73.9 
 
 
341 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  71.55 
 
 
342 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  71.85 
 
 
342 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  73.9 
 
 
341 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  72.43 
 
 
341 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  73.1 
 
 
342 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  70.67 
 
 
342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  70.97 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  67.45 
 
 
340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  59.24 
 
 
341 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  60.7 
 
 
341 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  58.82 
 
 
348 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  58.02 
 
 
343 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  62.35 
 
 
343 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  56.56 
 
 
343 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  57.14 
 
 
343 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  57.85 
 
 
345 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  57.14 
 
 
343 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  57.85 
 
 
343 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  59.24 
 
 
344 aa  382  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  57.14 
 
 
343 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  57.31 
 
 
340 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  60.23 
 
 
342 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  57.02 
 
 
344 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  56.14 
 
 
342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  53.24 
 
 
343 aa  348  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  52.35 
 
 
340 aa  348  6e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  54.05 
 
 
349 aa  348  7e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  52.4 
 
 
341 aa  345  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  50.29 
 
 
341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  53.85 
 
 
339 aa  338  8e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  54.68 
 
 
364 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  53.51 
 
 
370 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  52.92 
 
 
368 aa  331  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  50.58 
 
 
344 aa  328  7e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  52.05 
 
 
365 aa  322  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  51.01 
 
 
345 aa  322  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  51.03 
 
 
373 aa  319  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  46.78 
 
 
346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  48.84 
 
 
366 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  48.84 
 
 
365 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  50.59 
 
 
363 aa  308  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  48.09 
 
 
362 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  49.41 
 
 
360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  49.27 
 
 
363 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  51.48 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  53.13 
 
 
363 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  51.06 
 
 
342 aa  298  7e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  51.93 
 
 
375 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  46.06 
 
 
368 aa  296  4e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  46.63 
 
 
370 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  49.57 
 
 
367 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  51.72 
 
 
372 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  48.39 
 
 
359 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  50 
 
 
365 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  47.52 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  50.58 
 
 
356 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  47.94 
 
 
361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  47.81 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  49.42 
 
 
364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  45.18 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  50 
 
 
372 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  46.22 
 
 
359 aa  269  5e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  45.62 
 
 
362 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  48.58 
 
 
369 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  43.41 
 
 
319 aa  258  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  45.05 
 
 
365 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  44.57 
 
 
322 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  42.94 
 
 
378 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  43.11 
 
 
319 aa  256  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  44.74 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  44.74 
 
 
350 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  46.4 
 
 
368 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  40.83 
 
 
322 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  42.18 
 
 
319 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  41.57 
 
 
360 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  40.64 
 
 
336 aa  248  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  43.82 
 
 
322 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  42.77 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  41.32 
 
 
319 aa  243  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  45.19 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  45.19 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  43.24 
 
 
319 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0439  6-phosphofructokinase  45.16 
 
 
320 aa  239  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  39.41 
 
 
332 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  40.41 
 
 
319 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  41 
 
 
319 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  40.94 
 
 
324 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  39.34 
 
 
319 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  40.59 
 
 
320 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  42.94 
 
 
319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  38.05 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 
326 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  41.59 
 
 
335 aa  235  8e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>