More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1047 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 366 aa  731    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  59.39 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  60.22 
 
 		 360 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  60.22 
 
 		 360 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  52.04 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3044  6-phosphofructokinase  50.27 
 
 		 357 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  50.96 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  46.88 
 
 		 390 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  48.26 
 
 		 365 aa  305  9.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  46.28 
 
 		 362 aa  301  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  46.45 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  45.75 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  45.88 
 
 		 360 aa  293  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  47.01 
 
 		 363 aa  291  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  46.43 
 
 		 370 aa  291  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  47.24 
 
 		 359 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  45.08 
 
 		 364 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  46.83 
 
 		 361 aa  288  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  46.03 
 
 		 363 aa  285  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0592  6-phosphofructokinase  45.6 
 
 		 360 aa  285  8e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00575817  normal  0.643142 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  44.81 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  45.14 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  44.81 
 
 		 365 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  44.72 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  43.72 
 
 		 370 aa  276  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1263  6-phosphofructokinase  41.63 
 
 		 403 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  42.32 
 
 		 368 aa  273  5.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0191  6-phosphofructokinase  40.55 
 
 		 390 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0186  6-phosphofructokinase  40.55 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.404214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  46.43 
 
 		 363 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  45.5 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  45.11 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  43.16 
 
 		 368 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  46.09 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  46.67 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  43.96 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  44.83 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  45.38 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  43.13 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  44.02 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  45.95 
 
 		 369 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  45.35 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  42.45 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  44.57 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  41.39 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  40.74 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  45.51 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  45.54 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  44.81 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  44.28 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  44.17 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  42.11 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  42.39 
 
 		 339 aa  243  5e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  44.61 
 
 		 341 aa  242  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  43.2 
 
 		 341 aa  242  9e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  44.84 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  45.4 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  43.98 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  42.09 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  43.24 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  43.11 
 
 		 344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  41.45 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  41.84 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  42.14 
 
 		 342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  42.01 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  43.22 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  41.72 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  46.11 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  41.99 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  43.84 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  42.03 
 
 		 350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  38.22 
 
 		 344 aa  225  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  41.76 
 
 		 350 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  40.99 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  38.37 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  41.14 
 
 		 342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  42.22 
 
 		 345 aa  222  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  42.14 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  38.03 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  42.09 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  40.63 
 
 		 319 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  41.07 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  41.4 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  41.4 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  41.4 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  41.4 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  41.4 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  42.01 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  41.4 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  41.4 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  40.47 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  37.32 
 
 		 319 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  42.94 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  41.11 
 
 		 319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  41.11 
 
 		 319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  40.82 
 
 		 319 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  37.09 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  38.04 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  37.24 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  41.56 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>