More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1037 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  100 
 
 
341 aa  681    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  90.32 
 
 
341 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  85.92 
 
 
341 aa  597  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  83.58 
 
 
341 aa  584  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  83.58 
 
 
341 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  78.3 
 
 
342 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  78.01 
 
 
342 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  78.95 
 
 
342 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  78.59 
 
 
341 aa  541  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  73.9 
 
 
341 aa  524  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  73.02 
 
 
346 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  73.31 
 
 
342 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  74.19 
 
 
341 aa  502  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  73.9 
 
 
341 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  71.26 
 
 
340 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  59.65 
 
 
340 aa  403  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  60.64 
 
 
341 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  61.88 
 
 
344 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  59.82 
 
 
341 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  60.65 
 
 
343 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  56.27 
 
 
343 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  57.14 
 
 
343 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  59.94 
 
 
342 aa  378  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  57.06 
 
 
348 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  58.26 
 
 
349 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  56.27 
 
 
345 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  55.1 
 
 
343 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  55.1 
 
 
343 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  55.1 
 
 
343 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  54.84 
 
 
344 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  55.85 
 
 
342 aa  363  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  53.94 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  55.52 
 
 
344 aa  354  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  54.44 
 
 
339 aa  350  3e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  50.15 
 
 
341 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  52.12 
 
 
341 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  50 
 
 
343 aa  335  7e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  48.68 
 
 
340 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  52.19 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  51.46 
 
 
368 aa  326  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  53.73 
 
 
363 aa  325  9e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  50.87 
 
 
366 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  52.92 
 
 
364 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  50.58 
 
 
365 aa  322  7e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  51.92 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  51.99 
 
 
345 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.41 
 
 
346 aa  319  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  51.31 
 
 
370 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  50.15 
 
 
370 aa  315  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  52.29 
 
 
372 aa  315  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  50.73 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  49.27 
 
 
363 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  50 
 
 
362 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  50.3 
 
 
358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  46.76 
 
 
368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  48.55 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  49.71 
 
 
372 aa  302  6.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  47.67 
 
 
363 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  51.36 
 
 
342 aa  299  5e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  49.13 
 
 
367 aa  298  7e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  50.3 
 
 
375 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  50.45 
 
 
351 aa  295  6e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  47.31 
 
 
372 aa  295  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  51.48 
 
 
356 aa  292  5e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  48.09 
 
 
359 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  48.36 
 
 
365 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  49.13 
 
 
365 aa  285  8e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  47.67 
 
 
359 aa  281  8.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  47.35 
 
 
361 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  46.87 
 
 
350 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  46.57 
 
 
350 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  46.96 
 
 
364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  47.59 
 
 
378 aa  272  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  47.71 
 
 
369 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  46.25 
 
 
362 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  41.42 
 
 
322 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  42.69 
 
 
336 aa  253  3e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  38.94 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  42.65 
 
 
319 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  44.96 
 
 
368 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  41.3 
 
 
360 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  43.24 
 
 
322 aa  248  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  42.35 
 
 
319 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  41.47 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  43.53 
 
 
322 aa  245  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  43.24 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  40.29 
 
 
319 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  44.19 
 
 
360 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  44.19 
 
 
360 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  45.4 
 
 
366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  41.67 
 
 
319 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  41.67 
 
 
319 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 
319 aa  239  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  42.64 
 
 
319 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  38.94 
 
 
327 aa  238  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  41 
 
 
319 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  41.96 
 
 
319 aa  237  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  43.66 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  39.82 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  40.71 
 
 
319 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>