More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2871 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  100 
 
 		 345 aa  697    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  84.26 
 
 		 343 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  83.97 
 
 		 343 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  82.8 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  82.22 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  82.22 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  82.22 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  65.89 
 
 		 342 aa  428  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  59.88 
 
 		 341 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  59.01 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  59.48 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  59.01 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  58.72 
 
 		 341 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  57.85 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  58.43 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  57.56 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  56.85 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  56.56 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  58.31 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  56.27 
 
 		 341 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  56.1 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  56.69 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  55.81 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  53.08 
 
 		 348 aa  351  8e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  54.23 
 
 		 344 aa  346  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  52.05 
 
 		 343 aa  335  5.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  53.25 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  53.04 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  52.07 
 
 		 340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  51.35 
 
 		 341 aa  325  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  49.13 
 
 		 342 aa  325  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  50.29 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  50.86 
 
 		 344 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  51.13 
 
 		 364 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  50.73 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  50.29 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  49.56 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  51.31 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  49.3 
 
 		 373 aa  305  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  46.67 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  49.41 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  47.54 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  49.57 
 
 		 345 aa  301  7.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  49.14 
 
 		 360 aa  298  7e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  45.66 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  46.4 
 
 		 365 aa  297  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  49.27 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  46.11 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  46.51 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  46.5 
 
 		 362 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 356 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  49.13 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  48.22 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  47.85 
 
 		 351 aa  290  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  47.56 
 
 		 372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  48.96 
 
 		 375 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  48.14 
 
 		 372 aa  285  9e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  44.57 
 
 		 370 aa  285  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  46.04 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  45.16 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  45.19 
 
 		 361 aa  278  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  43.77 
 
 		 346 aa  275  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  46.22 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  44.18 
 
 		 372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  44.64 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  44.77 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  44.64 
 
 		 365 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  46.84 
 
 		 369 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  46.97 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  45.4 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  45.56 
 
 		 350 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  46.27 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  44.07 
 
 		 378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  45.43 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  44.83 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  41.72 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  43.94 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  43.94 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  41.42 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  41.42 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  43.03 
 
 		 335 aa  237  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  40.88 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  41.37 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  40.36 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  42.31 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  42.94 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  44.44 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  42.44 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  42.44 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  42.44 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  42.44 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  40.24 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  42.44 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  42.44 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  42.44 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  42.34 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  43.11 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  38.28 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>