More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6053 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 342 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  80.7 
 
 		 341 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  78.95 
 
 		 341 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  79.82 
 
 		 341 aa  541  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  79.53 
 
 		 341 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  78.36 
 
 		 341 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  76.61 
 
 		 342 aa  524  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  76.32 
 
 		 342 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  77.49 
 
 		 341 aa  522  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  73.39 
 
 		 341 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  72.51 
 
 		 346 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  73.39 
 
 		 341 aa  488  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  73.68 
 
 		 342 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  73.1 
 
 		 341 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  70.76 
 
 		 340 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  60.64 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  61.81 
 
 		 344 aa  401  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  58.14 
 
 		 343 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  59.01 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  58.14 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  61.81 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  57.27 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  58.48 
 
 		 341 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  57.27 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  57.27 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  56.89 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  57.27 
 
 		 343 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  56.81 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  58.48 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  60.96 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  56.56 
 
 		 344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  55.69 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  53.39 
 
 		 339 aa  346  3e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  54.09 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  53.64 
 
 		 370 aa  341  9e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  50.88 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  52.33 
 
 		 344 aa  337  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  52.79 
 
 		 341 aa  335  9e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  51.3 
 
 		 345 aa  331  9e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  50.73 
 
 		 343 aa  328  6e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  50.44 
 
 		 340 aa  328  8e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  51.47 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.44 
 
 		 346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  51.6 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  53.96 
 
 		 364 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  52.54 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  50.44 
 
 		 363 aa  309  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  49.27 
 
 		 363 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  50.3 
 
 		 358 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  49.56 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  50 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  49.71 
 
 		 365 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  49.71 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  52.57 
 
 		 372 aa  302  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  49.86 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  52.65 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  51.18 
 
 		 342 aa  295  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  50.29 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  50.59 
 
 		 351 aa  291  9e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  46.71 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  50 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  46.94 
 
 		 363 aa  288  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  46.8 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  48.68 
 
 		 375 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  48.41 
 
 		 367 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  49.27 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  45.81 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  48.56 
 
 		 364 aa  272  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  48.57 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  47.25 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  48.27 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  42.82 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  45.48 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  45.18 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  41.47 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  45.72 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  45.72 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  46.26 
 
 		 368 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  41.18 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  43.98 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  42.6 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  40.83 
 
 		 336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  42.94 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  39.82 
 
 		 321 aa  236  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  39.53 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3044  6-phosphofructokinase  42.37 
 
 		 357 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  39.05 
 
 		 319 aa  232  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  41.72 
 
 		 319 aa  232  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  37.68 
 
 		 332 aa  232  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  43.53 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  40.29 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  41.38 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  41.18 
 
 		 320 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3102  6-phosphofructokinase  39.77 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000237495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  42.65 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  39.58 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  37.94 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  40.75 
 
 		 319 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>