More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1260 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  100 
 
 
336 aa  674    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0642  6-phosphofructokinase  64.46 
 
 
333 aa  418  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  43.86 
 
 
341 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  44.35 
 
 
349 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  42.69 
 
 
341 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  42.69 
 
 
346 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  43.64 
 
 
342 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  41.81 
 
 
341 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  41.81 
 
 
341 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  42.81 
 
 
348 aa  257  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  42.69 
 
 
342 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  43.64 
 
 
342 aa  255  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  41.81 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  44.51 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  42.69 
 
 
341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  42.23 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  41.94 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  42.99 
 
 
344 aa  251  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  42.86 
 
 
346 aa  249  5e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  42.47 
 
 
341 aa  248  9e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  40.64 
 
 
341 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  44.12 
 
 
342 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  41.92 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  42.68 
 
 
340 aa  243  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  43.03 
 
 
341 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  41.81 
 
 
368 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  40.83 
 
 
342 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  39.18 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  40.42 
 
 
343 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  41.3 
 
 
351 aa  225  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  38.58 
 
 
341 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  41.14 
 
 
339 aa  223  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  40.12 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  37.9 
 
 
342 aa  220  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  37.86 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  39 
 
 
370 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  37.69 
 
 
340 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  38.64 
 
 
360 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  41.76 
 
 
373 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  38.97 
 
 
345 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  40.12 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  40.06 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  40.61 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  37.94 
 
 
364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  39.76 
 
 
350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  38.94 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  39.47 
 
 
365 aa  209  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  37.83 
 
 
370 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  38.63 
 
 
319 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  38.86 
 
 
372 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  37.65 
 
 
343 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  37.65 
 
 
343 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  37.65 
 
 
343 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  36.04 
 
 
319 aa  205  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  37.69 
 
 
332 aa  205  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  40.7 
 
 
342 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  38.67 
 
 
360 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  38.97 
 
 
358 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  40.46 
 
 
364 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  36.53 
 
 
341 aa  202  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  37.46 
 
 
372 aa  202  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  37.69 
 
 
319 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  37.69 
 
 
319 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  38.24 
 
 
375 aa  202  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  37.64 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  38.2 
 
 
319 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  35.69 
 
 
343 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  38.34 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  37.69 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  38.51 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  37.39 
 
 
319 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  37.39 
 
 
319 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  37.39 
 
 
319 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  37.39 
 
 
319 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  37.39 
 
 
319 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  37.39 
 
 
319 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  37 
 
 
322 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  37.39 
 
 
319 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  36.6 
 
 
372 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  38.01 
 
 
363 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  38.02 
 
 
365 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  34.35 
 
 
326 aa  198  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  37.3 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  35.38 
 
 
366 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  36.7 
 
 
320 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  38.55 
 
 
369 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  38.53 
 
 
368 aa  194  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  36.39 
 
 
320 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  37.91 
 
 
363 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  35.38 
 
 
365 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  37.42 
 
 
347 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  37.35 
 
 
326 aa  193  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  37.46 
 
 
362 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  37.72 
 
 
367 aa  192  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2597  6-phosphofructokinase  36.09 
 
 
344 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0115361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  37.61 
 
 
359 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  34.53 
 
 
319 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  37.18 
 
 
324 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  37.54 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>