More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0239 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  79.14 
 
 		 418 aa  648    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  99.04 
 
 		 417 aa  855    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  77.94 
 
 		 418 aa  645    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 427 aa  881    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  61.54 
 
 		 421 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  61.3 
 
 		 420 aa  511  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  59.19 
 
 		 419 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  59.13 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  60.05 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  56.73 
 
 		 414 aa  485  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  56.73 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  58.37 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  57.72 
 
 		 418 aa  474  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  59.05 
 
 		 419 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  56.49 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  56.49 
 
 		 420 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  56.97 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  52.88 
 
 		 419 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  49.64 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  48.52 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  49.64 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  52.05 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  47.89 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  51.36 
 
 		 422 aa  361  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  44.98 
 
 		 424 aa  359  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  47.24 
 
 		 422 aa  352  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  49.29 
 
 		 417 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  46.28 
 
 		 418 aa  342  8e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  45.22 
 
 		 415 aa  332  9e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  45.15 
 
 		 409 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  44.44 
 
 		 415 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  43.77 
 
 		 414 aa  302  7.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  42.47 
 
 		 415 aa  295  8e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  40.24 
 
 		 414 aa  292  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  40.29 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  37.61 
 
 		 447 aa  259  8e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  35.68 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  35.43 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  38.11 
 
 		 404 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  34.82 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  36.02 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  35.88 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  36.45 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  36.59 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  34.75 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  35.31 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  35.07 
 
 		 404 aa  216  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  33.58 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  34.22 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  35.87 
 
 		 404 aa  196  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  35.28 
 
 		 378 aa  173  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  28.42 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.21 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  29.57 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.01 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  29.12 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  30.61 
 
 		 341 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  30.91 
 
 		 346 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  28.81 
 
 		 367 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  29.9 
 
 		 344 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  33.61 
 
 		 342 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  29.65 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  31.11 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  30.14 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  29.39 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  31.58 
 
 		 342 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  29.78 
 
 		 341 aa  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  33.94 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  29.88 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  30.25 
 
 		 341 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  30.14 
 
 		 341 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  32.21 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  28.32 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  27.9 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  30.61 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  32.53 
 
 		 343 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  28.02 
 
 		 341 aa  99.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  32.8 
 
 		 373 aa  99.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  29.35 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  30.58 
 
 		 360 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  28 
 
 		 368 aa  97.4  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  27.33 
 
 		 341 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  27.19 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  29.01 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  27.4 
 
 		 341 aa  94.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  30.38 
 
 		 343 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 336 aa  93.2  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  34.86 
 
 		 345 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  28.32 
 
 		 369 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  30 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  29.3 
 
 		 368 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  29.66 
 
 		 343 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  32.19 
 
 		 343 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  32.19 
 
 		 343 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  32.19 
 
 		 343 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0550  6-phosphofructokinase  25.25 
 
 		 401 aa  90.1  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000101268  normal  0.239253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  30.73 
 
 		 362 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>