More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3467 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  100 
 
 
388 aa  787    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  45.61 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  47.45 
 
 
402 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  47.33 
 
 
404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  45.5 
 
 
404 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  46.34 
 
 
405 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  46.34 
 
 
404 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  46.34 
 
 
406 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  33.59 
 
 
404 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  33.76 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  35.13 
 
 
415 aa  173  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  33.91 
 
 
418 aa  172  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  31.78 
 
 
400 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  31.52 
 
 
400 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  34.05 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  30.73 
 
 
407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  31.9 
 
 
403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  33.01 
 
 
414 aa  161  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  32.49 
 
 
414 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  32.99 
 
 
409 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  30.51 
 
 
414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  31.46 
 
 
419 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  32.98 
 
 
415 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  30.26 
 
 
414 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  30.46 
 
 
419 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  31.54 
 
 
421 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  32.4 
 
 
421 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  32.74 
 
 
418 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  30.67 
 
 
418 aa  149  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  31.11 
 
 
420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  30.71 
 
 
420 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  30.1 
 
 
420 aa  143  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  30.1 
 
 
420 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  32.05 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  33.42 
 
 
422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  32.35 
 
 
404 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  30.15 
 
 
419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 
427 aa  136  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  31.14 
 
 
419 aa  136  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  30 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  30.87 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  30.51 
 
 
418 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  30.92 
 
 
421 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  29.84 
 
 
447 aa  126  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  29.2 
 
 
424 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  32.02 
 
 
378 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  29.85 
 
 
418 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  31.06 
 
 
422 aa  121  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  27.71 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  29.82 
 
 
429 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  31.1 
 
 
340 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  29.34 
 
 
406 aa  106  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  30.66 
 
 
343 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  32.5 
 
 
341 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  31.97 
 
 
417 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  28.53 
 
 
340 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 
342 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.63 
 
 
348 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  29.97 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.41 
 
 
346 aa  97.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  30.77 
 
 
346 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.09 
 
 
349 aa  96.3  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  31.12 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  28.26 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  29.31 
 
 
341 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  29.75 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  27.66 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  27.32 
 
 
341 aa  90.5  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  28.83 
 
 
344 aa  89.7  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  27.81 
 
 
341 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  27.92 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  30.42 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0648  6-phosphofructokinase  28.47 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0623  6-phosphofructokinase  28.47 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.47 
 
 
461 aa  87  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  27.91 
 
 
341 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  26.32 
 
 
345 aa  86.3  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  27.75 
 
 
343 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  29.26 
 
 
342 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  27.91 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1743  6-phosphofructokinase  27.07 
 
 
416 aa  84  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  28.69 
 
 
342 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  27.78 
 
 
342 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  29.69 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.62 
 
 
439 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.1 
 
 
418 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  27.91 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  29.39 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  27.47 
 
 
343 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.58 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  27.2 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  27.94 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  27.96 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15800  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  26.3 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.79 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  26.92 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  28.06 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0592  6-phosphofructokinase  27.99 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00575817  normal  0.643142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  27.14 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>