More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0648 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0648  6-phosphofructokinase  100 
 
 
419 aa  847    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0623  6-phosphofructokinase  99.76 
 
 
419 aa  845    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1743  6-phosphofructokinase  50.24 
 
 
416 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2276  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  31.88 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.719856  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  34.15 
 
 
349 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  35.42 
 
 
340 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  34.58 
 
 
341 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  34.93 
 
 
348 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0020  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.37 
 
 
555 aa  148  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  34.47 
 
 
341 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  34.16 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
344 aa  146  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  34.47 
 
 
342 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  33.64 
 
 
341 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  31.82 
 
 
365 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1550  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.94 
 
 
560 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  34.89 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  33.52 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  33.43 
 
 
368 aa  140  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  34.58 
 
 
341 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  32.61 
 
 
342 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  32.53 
 
 
341 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  34.1 
 
 
365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  31.99 
 
 
342 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  32.5 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  32.5 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  32.5 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  32.77 
 
 
341 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  32.83 
 
 
346 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  34.49 
 
 
319 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  33.52 
 
 
343 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  33.05 
 
 
343 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  31.78 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  34.49 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  32.76 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  33.05 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  32.2 
 
 
350 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  37.93 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  36.76 
 
 
370 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  32.38 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  31.92 
 
 
350 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  33.09 
 
 
320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  31.39 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  33.7 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  33.7 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3375  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.74 
 
 
602 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.206133 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  30.55 
 
 
327 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  34.29 
 
 
327 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  31.61 
 
 
347 aa  127  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  30.4 
 
 
345 aa  127  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  31.29 
 
 
364 aa  126  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  39.91 
 
 
375 aa  126  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  38.5 
 
 
319 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  36.82 
 
 
341 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  32.88 
 
 
321 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  39.42 
 
 
356 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2597  6-phosphofructokinase  30.37 
 
 
344 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0115361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  30.1 
 
 
363 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  34.54 
 
 
319 aa  123  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  30.38 
 
 
343 aa  123  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  31.44 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  30.75 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  35.25 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  35.25 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  35.25 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  35.25 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  32.65 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  35.25 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  35.25 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  35.25 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  31.53 
 
 
336 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  35.25 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  32.21 
 
 
342 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  38.31 
 
 
341 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0163  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.13 
 
 
549 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  35.25 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  26.65 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  35.25 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 
319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  31.86 
 
 
373 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  35.15 
 
 
319 aa  120  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 
324 aa  120  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  29.38 
 
 
360 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  30.11 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  31.46 
 
 
319 aa  119  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  30.46 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  28.61 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  38.31 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0879  6-phosphofructokinase  28.69 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  33.89 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1007  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.41 
 
 
562 aa  117  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.124687 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  33.89 
 
 
319 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  29.02 
 
 
336 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  30.66 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  28.27 
 
 
322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  34.83 
 
 
328 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  34.22 
 
 
331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  36.32 
 
 
340 aa  116  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  33.5 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>