More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1550 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0163  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.62 
 
 
549 aa  640    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1550  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 
560 aa  1152    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1007  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  57.58 
 
 
562 aa  671    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.124687 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0020  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  54.61 
 
 
555 aa  619  1e-176  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0479  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  42.7 
 
 
548 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.736069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3375  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  43.61 
 
 
602 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.206133 
 
 
-
 
NC_002620  TC0477  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  43.6 
 
 
553 aa  423  1e-117  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.680887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1694  phosphofructokinase  36.66 
 
 
702 aa  293  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256037  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0623  6-phosphofructokinase  29.2 
 
 
419 aa  143  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1743  6-phosphofructokinase  27.84 
 
 
416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0648  6-phosphofructokinase  28.94 
 
 
419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  30.47 
 
 
349 aa  101  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  32.3 
 
 
341 aa  97.4  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2276  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  26.14 
 
 
445 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.719856  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  28.52 
 
 
365 aa  95.9  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  33.07 
 
 
341 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.28 
 
 
346 aa  94  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  28.69 
 
 
378 aa  93.6  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  30.74 
 
 
326 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2592  6-phosphofructokinase  28.96 
 
 
323 aa  91.3  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  30.71 
 
 
344 aa  90.9  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.52 
 
 
429 aa  90.1  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  31.38 
 
 
342 aa  90.1  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  31.71 
 
 
328 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  28.97 
 
 
346 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  29.34 
 
 
322 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  30.69 
 
 
342 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  29.46 
 
 
368 aa  87.8  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  32.65 
 
 
439 aa  87  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  28.97 
 
 
341 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  31.28 
 
 
344 aa  86.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  29.1 
 
 
327 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  28.8 
 
 
375 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  28.97 
 
 
370 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  30.77 
 
 
359 aa  86.3  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  30.92 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  25.73 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  27.92 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  26.27 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  29.13 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  29.22 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  27.08 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  30.8 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  27.8 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  28.09 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  28.09 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0642  6-phosphofructokinase  27.69 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  27.67 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  32.35 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.4 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  28.93 
 
 
322 aa  84  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  28.93 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  27.72 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  31.98 
 
 
341 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  31.08 
 
 
341 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  26.14 
 
 
323 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3024  6-phosphofructokinase  27.94 
 
 
328 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  28.02 
 
 
322 aa  83.2  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  26.53 
 
 
343 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  28.1 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  26.67 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.52 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0033  6-phosphofructokinase  32.67 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.2 
 
 
445 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  27.95 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.77 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  28.28 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0556  6-phosphofructokinase  26.64 
 
 
329 aa  82  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0367843  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  27.95 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  27.19 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  28.86 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  31.09 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  31.09 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  31.09 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  31.09 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  31.09 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  28.88 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  31.09 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.1 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  31.09 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  31.09 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  28.98 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  31.09 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  27.56 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.75 
 
 
447 aa  80.9  0.00000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  26.34 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  29.29 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  28.05 
 
 
319 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  28.4 
 
 
347 aa  80.1  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  31.53 
 
 
341 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  32.04 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  32.39 
 
 
342 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  25.19 
 
 
321 aa  80.1  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  31.53 
 
 
341 aa  79.7  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  28.74 
 
 
433 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  27.24 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  27.24 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.35 
 
 
461 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  27.24 
 
 
343 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  26.84 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>