More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2799 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  100 
 
 
440 aa  880    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  69.41 
 
 
445 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  68.86 
 
 
445 aa  628  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  68.66 
 
 
461 aa  591  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  62.39 
 
 
439 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  55.96 
 
 
439 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.36 
 
 
429 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.4 
 
 
450 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  54.06 
 
 
429 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  52.46 
 
 
435 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.35 
 
 
444 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  49.32 
 
 
437 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.37 
 
 
429 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.69 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.73 
 
 
438 aa  415  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  47.8 
 
 
437 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.47 
 
 
448 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  45.35 
 
 
447 aa  398  9.999999999999999e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47690  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  48.53 
 
 
564 aa  336  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51286  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  45.69 
 
 
563 aa  335  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50424  phosphofructokinase  46.21 
 
 
515 aa  334  2e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  46.38 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  43.95 
 
 
433 aa  312  7.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1331  phosphofructokinase  27.95 
 
 
680 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  34.18 
 
 
346 aa  160  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  34.62 
 
 
368 aa  156  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  37.68 
 
 
340 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  35.26 
 
 
360 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  36.08 
 
 
348 aa  149  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  36.39 
 
 
341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  35.17 
 
 
341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  36.65 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  35.16 
 
 
349 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  35.61 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  36.08 
 
 
344 aa  147  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  35.65 
 
 
340 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  34.96 
 
 
341 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  41.18 
 
 
341 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  34.15 
 
 
370 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  35.96 
 
 
341 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  34.38 
 
 
341 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  32.97 
 
 
365 aa  143  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  34.51 
 
 
373 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  37.42 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  31.62 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  34.55 
 
 
345 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  34.96 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  35.94 
 
 
342 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  35.07 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  32.35 
 
 
364 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  34.01 
 
 
340 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  34.29 
 
 
343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  34.94 
 
 
341 aa  136  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  34.57 
 
 
351 aa  136  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  34.94 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  33.71 
 
 
343 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  34.02 
 
 
343 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  34.38 
 
 
341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  30.05 
 
 
368 aa  134  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  33.43 
 
 
344 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  31.86 
 
 
359 aa  133  6.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  33.24 
 
 
343 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  33.52 
 
 
346 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  34.4 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  32.34 
 
 
359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  33.72 
 
 
339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  34.4 
 
 
345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  33.14 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  33.14 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  33.14 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  32.63 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  31.06 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  33.68 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  33.97 
 
 
356 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  33.33 
 
 
341 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  31.09 
 
 
362 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  33.51 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  31 
 
 
366 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  31.18 
 
 
361 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  31.9 
 
 
350 aa  126  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  31.08 
 
 
363 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  32.62 
 
 
363 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  34.81 
 
 
341 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  30.73 
 
 
365 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  30.59 
 
 
363 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  31.61 
 
 
350 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  30.43 
 
 
362 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  33.03 
 
 
365 aa  123  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  33.74 
 
 
370 aa  123  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  34.83 
 
 
342 aa  123  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  31.84 
 
 
336 aa  122  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1769  6-phosphofructokinase  31.27 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  32.84 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0616  6-phosphofructokinase  30.26 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.675369  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  30.48 
 
 
335 aa  122  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  32.76 
 
 
342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  31.5 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  31.69 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  29.83 
 
 
319 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>