More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2114 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 
437 aa  904    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  69.37 
 
 
437 aa  626  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  68.63 
 
 
450 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  69.1 
 
 
444 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  66.59 
 
 
448 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  65.57 
 
 
435 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  56.71 
 
 
444 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  55.32 
 
 
429 aa  458  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  52.06 
 
 
429 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.48 
 
 
445 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  52.72 
 
 
429 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  49.32 
 
 
440 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.11 
 
 
445 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.15 
 
 
461 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  47.74 
 
 
438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.08 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.8 
 
 
439 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  43.54 
 
 
439 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47690  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  47.26 
 
 
564 aa  328  9e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51286  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  46.6 
 
 
563 aa  315  7e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  42.11 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  44.33 
 
 
416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50424  phosphofructokinase  44.94 
 
 
515 aa  311  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1331  phosphofructokinase  28.6 
 
 
680 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.75 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  32.56 
 
 
340 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  32.1 
 
 
343 aa  143  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  33.81 
 
 
341 aa  142  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  32.57 
 
 
345 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  33.99 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  33.71 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  34.31 
 
 
341 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  33.14 
 
 
341 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  33.15 
 
 
342 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  32.57 
 
 
341 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  30.11 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  33.82 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  32.2 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  34.21 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  31.07 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  32.76 
 
 
348 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  31.92 
 
 
343 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  33.72 
 
 
341 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  32.39 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  30.99 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  30.99 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  30.99 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  30.99 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  31.59 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  33.33 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  29.51 
 
 
364 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  33.14 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  32.57 
 
 
342 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  31.32 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  31.36 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  32.95 
 
 
340 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  30.65 
 
 
370 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  30.27 
 
 
368 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  31.27 
 
 
343 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  31.7 
 
 
341 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  31.2 
 
 
342 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  28.42 
 
 
365 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  30.65 
 
 
373 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  31.62 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  27.61 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  27.93 
 
 
350 aa  120  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  29.71 
 
 
339 aa  120  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  31.53 
 
 
342 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  34.65 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  34.65 
 
 
366 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  28.99 
 
 
367 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  29.63 
 
 
351 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  34.98 
 
 
390 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  34.26 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  30.92 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  29.8 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  35.08 
 
 
364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  34.27 
 
 
363 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  29.3 
 
 
372 aa  114  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  29.71 
 
 
343 aa  113  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  33.86 
 
 
365 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  37.39 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  33.47 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  37.55 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  32.81 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  30.97 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  30.03 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  34.18 
 
 
344 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  34.39 
 
 
359 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  28.49 
 
 
324 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  28.7 
 
 
355 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  34.78 
 
 
361 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  35.6 
 
 
370 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  28.77 
 
 
322 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0592  6-phosphofructokinase  32.79 
 
 
360 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00575817  normal  0.643142 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  26.8 
 
 
336 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  28.45 
 
 
319 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  28.24 
 
 
319 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>