More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2111 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 
444 aa  912    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  56.71 
 
 
437 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  62.53 
 
 
450 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  56.35 
 
 
444 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  60.68 
 
 
448 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  58.82 
 
 
435 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  55.14 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  52.91 
 
 
437 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.5 
 
 
429 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  52.28 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.23 
 
 
445 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.01 
 
 
445 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.72 
 
 
461 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  50.35 
 
 
440 aa  415  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.93 
 
 
438 aa  411  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  47.74 
 
 
447 aa  411  1e-113  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.62 
 
 
439 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  47.56 
 
 
439 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47690  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  43.68 
 
 
564 aa  326  4.0000000000000003e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  45.03 
 
 
433 aa  323  4e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51286  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  46.35 
 
 
563 aa  318  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  46.11 
 
 
416 aa  316  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50424  phosphofructokinase  45 
 
 
515 aa  308  9e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1331  phosphofructokinase  30.09 
 
 
680 aa  166  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  32.77 
 
 
346 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  35.43 
 
 
342 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  34.76 
 
 
341 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  34.55 
 
 
345 aa  156  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 
343 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  34.56 
 
 
340 aa  152  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  34.57 
 
 
342 aa  153  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  33.82 
 
 
348 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  34.44 
 
 
343 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  34.96 
 
 
341 aa  149  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  34.54 
 
 
343 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  35.11 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  33.9 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  35.11 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  34.86 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  35.77 
 
 
342 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  34.93 
 
 
341 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  34.57 
 
 
343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  32.86 
 
 
342 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
365 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  34.86 
 
 
341 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  33.05 
 
 
344 aa  143  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  33.15 
 
 
346 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  31.41 
 
 
349 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  31.1 
 
 
364 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  34.59 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  34.36 
 
 
340 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  33.71 
 
 
341 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  34.48 
 
 
373 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  29.91 
 
 
350 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  30.9 
 
 
344 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  32.47 
 
 
345 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  29.91 
 
 
350 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  32.15 
 
 
351 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  32.41 
 
 
343 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  32.41 
 
 
343 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  32.41 
 
 
343 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  30.33 
 
 
368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  31.1 
 
 
363 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  31.98 
 
 
364 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  33.43 
 
 
368 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  34.84 
 
 
341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  31.61 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  35.6 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  33.79 
 
 
342 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  31.71 
 
 
362 aa  129  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  35.02 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  31.06 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  30.75 
 
 
324 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  36.05 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  29.57 
 
 
366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  35.66 
 
 
375 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  29.83 
 
 
339 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  30.68 
 
 
343 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  29.23 
 
 
360 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  29.67 
 
 
360 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  35.8 
 
 
372 aa  123  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  30.68 
 
 
360 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  30.68 
 
 
360 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  30.59 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  31.07 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  29.6 
 
 
335 aa  121  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  33.1 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  32.26 
 
 
356 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  29.81 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  29.72 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  29.53 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  30.42 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  28.97 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  30.23 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  30.27 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0592  6-phosphofructokinase  30.46 
 
 
360 aa  117  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00575817  normal  0.643142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  36.73 
 
 
390 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  34.94 
 
 
363 aa  117  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  28.95 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  28 
 
 
324 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>