More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1331 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1331  phosphofructokinase  100 
 
 
680 aa  1423    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30 
 
 
448 aa  180  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.49 
 
 
450 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.95 
 
 
437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.12 
 
 
444 aa  174  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.25 
 
 
435 aa  169  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.18 
 
 
445 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.09 
 
 
444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.6 
 
 
437 aa  162  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.93 
 
 
461 aa  161  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.62 
 
 
447 aa  160  7e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.94 
 
 
445 aa  160  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.29 
 
 
429 aa  157  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.55 
 
 
439 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  27.95 
 
 
440 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.15 
 
 
429 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.94 
 
 
438 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.8 
 
 
439 aa  144  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25 
 
 
429 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50424  phosphofructokinase  27.11 
 
 
515 aa  133  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51286  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  27.82 
 
 
563 aa  133  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  26.71 
 
 
416 aa  124  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47690  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  27.5 
 
 
564 aa  124  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  26.59 
 
 
433 aa  117  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  25.37 
 
 
343 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  27.16 
 
 
343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  25.38 
 
 
365 aa  114  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  27.9 
 
 
343 aa  114  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  26.12 
 
 
341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  25.12 
 
 
370 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  26.25 
 
 
341 aa  108  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  25.44 
 
 
341 aa  108  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  25.74 
 
 
368 aa  107  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  25.71 
 
 
345 aa  107  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  29.02 
 
 
319 aa  106  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  26.67 
 
 
345 aa  107  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  25.84 
 
 
372 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  25.12 
 
 
360 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  24.7 
 
 
341 aa  106  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  25.44 
 
 
351 aa  104  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  24.26 
 
 
340 aa  104  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  26.67 
 
 
343 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  26.67 
 
 
343 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  24.76 
 
 
364 aa  104  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  26.67 
 
 
343 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  25.67 
 
 
342 aa  104  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  26.29 
 
 
343 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  24.63 
 
 
341 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  26.63 
 
 
372 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  27.65 
 
 
364 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  24.75 
 
 
344 aa  102  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  23.18 
 
 
365 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  24.44 
 
 
342 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  22.91 
 
 
366 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  26.55 
 
 
341 aa  101  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  29.27 
 
 
356 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  25.93 
 
 
342 aa  100  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3044  6-phosphofructokinase  26.62 
 
 
357 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0957436  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  24.76 
 
 
369 aa  99.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  24.88 
 
 
340 aa  97.8  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  25.12 
 
 
342 aa  98.2  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  24.38 
 
 
342 aa  97.8  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  23.45 
 
 
348 aa  97.8  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  28.52 
 
 
324 aa  97.8  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  28.33 
 
 
321 aa  97.8  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  24.38 
 
 
346 aa  97.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  28.21 
 
 
390 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  25.58 
 
 
355 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  29.86 
 
 
320 aa  95.5  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  22.67 
 
 
339 aa  95.1  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  24.5 
 
 
341 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  25.92 
 
 
365 aa  95.5  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  25.7 
 
 
319 aa  94.7  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  24.38 
 
 
375 aa  94.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  22.64 
 
 
365 aa  94.4  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  24.88 
 
 
341 aa  93.2  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  27.04 
 
 
324 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  27.06 
 
 
322 aa  93.6  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  25 
 
 
341 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  24.19 
 
 
340 aa  93.2  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  23.44 
 
 
344 aa  93.6  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  24.09 
 
 
358 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  26.34 
 
 
320 aa  92.8  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  27.38 
 
 
367 aa  92.8  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  25.44 
 
 
320 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  25.44 
 
 
320 aa  92  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  25.44 
 
 
320 aa  92  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  25.44 
 
 
320 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  25.44 
 
 
320 aa  92  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  25.44 
 
 
320 aa  92  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  25.44 
 
 
320 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  26.67 
 
 
319 aa  92  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  26.67 
 
 
319 aa  92  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  25.44 
 
 
320 aa  92  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  25.44 
 
 
320 aa  92  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  28.33 
 
 
320 aa  91.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  27.83 
 
 
320 aa  91.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  24.05 
 
 
363 aa  91.3  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  24 
 
 
341 aa  91.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  22.89 
 
 
368 aa  91.3  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>