More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1589 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  77.68 
 
 
448 aa  721    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 
450 aa  925    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  78.91 
 
 
444 aa  712    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  70 
 
 
435 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  67.7 
 
 
437 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  68.63 
 
 
437 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  62.53 
 
 
444 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  54.57 
 
 
429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.63 
 
 
429 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  54.95 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  57.91 
 
 
445 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  51.4 
 
 
440 aa  421  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.5 
 
 
445 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50.12 
 
 
438 aa  410  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50 
 
 
461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.51 
 
 
447 aa  389  1e-107  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  49.44 
 
 
439 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50 
 
 
439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47690  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  46.83 
 
 
564 aa  322  9.999999999999999e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51286  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  44.06 
 
 
563 aa  307  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50424  phosphofructokinase  42.18 
 
 
515 aa  307  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  42.26 
 
 
416 aa  302  8.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  45 
 
 
433 aa  301  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1331  phosphofructokinase  29.49 
 
 
680 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  33.04 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  33.62 
 
 
348 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  33.14 
 
 
341 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  32.6 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  31.99 
 
 
372 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  34.88 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  34.15 
 
 
342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  34.49 
 
 
341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  32.86 
 
 
342 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  34.81 
 
 
341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  33.14 
 
 
341 aa  133  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  33.05 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  34.35 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  31.54 
 
 
372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  32.57 
 
 
342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  31.55 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  33.33 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  32.94 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  30.88 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  31.93 
 
 
343 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  31.79 
 
 
340 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  32.73 
 
 
366 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  31.41 
 
 
324 aa  128  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  31.96 
 
 
343 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  31.18 
 
 
368 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  31 
 
 
364 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  32.28 
 
 
341 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  32.72 
 
 
340 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  31.27 
 
 
351 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  32.88 
 
 
373 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  30.32 
 
 
367 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  30.36 
 
 
364 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  31.83 
 
 
345 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  33.24 
 
 
342 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  29.57 
 
 
319 aa  123  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  30.21 
 
 
341 aa  123  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  30.52 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  30.65 
 
 
370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  31.92 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  31.99 
 
 
341 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  31.36 
 
 
343 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  30.64 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  32.52 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  32.93 
 
 
344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  35.15 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  31.38 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  35.27 
 
 
356 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  31.4 
 
 
340 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0592  6-phosphofructokinase  30.35 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00575817  normal  0.643142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  30.55 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  35.2 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  31.02 
 
 
343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  31.02 
 
 
343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  31.02 
 
 
343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  29.1 
 
 
339 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  28.74 
 
 
350 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  31.07 
 
 
363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  30.79 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  28.45 
 
 
350 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  28.86 
 
 
319 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  34.27 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  29.57 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  32.2 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  29.79 
 
 
365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  29.14 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 
335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  31.1 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3044  6-phosphofructokinase  29.21 
 
 
357 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0957436  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  29.39 
 
 
320 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1263  6-phosphofructokinase  34.1 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  33.56 
 
 
370 aa  113  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  32.52 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  30.06 
 
 
344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  29.67 
 
 
324 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  31.2 
 
 
368 aa  111  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>