More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0616 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0616  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 384 aa  786    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.675369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  64.16 
 
 		 385 aa  522  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  63.9 
 
 		 385 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  57.96 
 
 		 390 aa  454  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  57.7 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0376  6-phosphofructokinase  50.9 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3015  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  53.12 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1623  6-phosphofructokinase  46.13 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0911  6-phosphofructokinase  46.67 
 
 		 407 aa  346  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178607  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1732  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  45.78 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2085  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  45.9 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1871  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  45.38 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.444059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1792  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  45.38 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  43.46 
 
 		 398 aa  325  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  38.44 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  37.63 
 
 		 341 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  36.83 
 
 		 341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  37.17 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  37.6 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  37.63 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  35.56 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  37.07 
 
 		 341 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  37.07 
 
 		 349 aa  209  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  37.36 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  37.57 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  36.39 
 
 		 345 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  35.48 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  35.68 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  37.54 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  36.83 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  35.42 
 
 		 351 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  36.19 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  37.89 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  36.36 
 
 		 341 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  35.83 
 
 		 341 aa  202  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  34.72 
 
 		 341 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  35.56 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  35.56 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  36.29 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  36.56 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  35.68 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  36.54 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  35.24 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  36.53 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  35.36 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  34.67 
 
 		 342 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  35.73 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  34.76 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  35.06 
 
 		 361 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  36.2 
 
 		 369 aa  192  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  35.46 
 
 		 363 aa  192  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  33.98 
 
 		 365 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  35.79 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  34.33 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  35.89 
 
 		 339 aa  189  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  36.11 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  33.98 
 
 		 373 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  34.35 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  34.63 
 
 		 340 aa  186  8e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  36.39 
 
 		 342 aa  186  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  33.79 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  34.63 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  32.95 
 
 		 364 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  33.42 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  35.96 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  34.06 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  33.96 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  33.99 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  34.93 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  36.18 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  33.98 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  32.35 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  34.07 
 
 		 359 aa  179  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  37.29 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  33.81 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  33.06 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  33.43 
 
 		 324 aa  177  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  34.16 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  35.38 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  33.69 
 
 		 343 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  33.69 
 
 		 343 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  33.69 
 
 		 343 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  33.06 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  33.98 
 
 		 360 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  33.98 
 
 		 360 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  32.6 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  32.15 
 
 		 319 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  32.15 
 
 		 319 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  31 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  32.2 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  31.13 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  34.31 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  31.37 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  32.35 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  32.29 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  33.63 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  33.89 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  34.17 
 
 		 350 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  32.22 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>