More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0376 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0376  6-phosphofructokinase  100 
 
 
390 aa  803    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  58.76 
 
 
390 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  58.51 
 
 
390 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  52.82 
 
 
385 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  52.56 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0616  6-phosphofructokinase  50.9 
 
 
384 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.675369  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3015  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  46.41 
 
 
366 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494016  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1623  6-phosphofructokinase  43 
 
 
399 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1732  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  42.49 
 
 
394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770131  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1871  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  42.46 
 
 
394 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.444059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1792  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  42.46 
 
 
394 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2085  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  42.2 
 
 
394 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0911  6-phosphofructokinase  42.2 
 
 
407 aa  295  9e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  41.34 
 
 
398 aa  292  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  36.44 
 
 
349 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  36.59 
 
 
341 aa  193  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  34.37 
 
 
372 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  36.74 
 
 
342 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  34.24 
 
 
365 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  35.26 
 
 
341 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  32.87 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  33.62 
 
 
348 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  32.53 
 
 
343 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  34.97 
 
 
341 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
341 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  33.24 
 
 
344 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  33.8 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  32.33 
 
 
341 aa  180  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  32.87 
 
 
341 aa  180  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  36.01 
 
 
341 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  35.17 
 
 
340 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  33.62 
 
 
356 aa  176  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  32.98 
 
 
346 aa  176  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  34.1 
 
 
341 aa  176  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  34.77 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  33.16 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  34.97 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  32.71 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  34.08 
 
 
370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  34.64 
 
 
368 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  33.78 
 
 
359 aa  172  7.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
364 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  33.43 
 
 
342 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  33.61 
 
 
340 aa  170  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  34.08 
 
 
336 aa  170  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  33.98 
 
 
342 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  32.76 
 
 
362 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  35.14 
 
 
342 aa  169  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  35.01 
 
 
342 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  31.71 
 
 
359 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  33.53 
 
 
346 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  31.08 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  31.98 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  32.11 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  33.99 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  32.88 
 
 
375 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  35.9 
 
 
342 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  31.83 
 
 
345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  33.06 
 
 
364 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  32.49 
 
 
343 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  30.59 
 
 
324 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  31.78 
 
 
363 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  32.21 
 
 
368 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  31.65 
 
 
343 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  32.96 
 
 
369 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  31.72 
 
 
373 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
363 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  30.23 
 
 
360 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  31.79 
 
 
366 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  31.92 
 
 
365 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  31.1 
 
 
372 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  30.83 
 
 
344 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  30.32 
 
 
340 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  31.79 
 
 
365 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  31.99 
 
 
320 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  33.61 
 
 
343 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0642  6-phosphofructokinase  31.09 
 
 
333 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  31.7 
 
 
320 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  31.44 
 
 
339 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  30.94 
 
 
365 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  31.48 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  30.81 
 
 
343 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  30.81 
 
 
343 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  30.81 
 
 
343 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  31.33 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  31.33 
 
 
319 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  32.51 
 
 
363 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  29.51 
 
 
368 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  31.98 
 
 
340 aa  150  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  29.49 
 
 
319 aa  149  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  31.59 
 
 
320 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  30.73 
 
 
345 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  31.03 
 
 
320 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  30.72 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  32.35 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  31.06 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  30.08 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  31.01 
 
 
331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  30.72 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  30.56 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>