More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3015 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3015  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  100 
 
 		 366 aa  730    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0616  6-phosphofructokinase  53.12 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.675369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  50.39 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  50.13 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  48.56 
 
 		 390 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  48.3 
 
 		 390 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0376  6-phosphofructokinase  46.41 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2085  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  41.75 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1792  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  41.75 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1871  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  41.75 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.444059  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0911  6-phosphofructokinase  42.01 
 
 		 407 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1623  6-phosphofructokinase  40.52 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1732  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  40.87 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  40.79 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  40.94 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  38.04 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  40.74 
 
 		 340 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  38.59 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  37.82 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  37.88 
 
 		 372 aa  206  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  38.64 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  37.46 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  38.62 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  36.77 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  38.35 
 
 		 341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  37.75 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  39.38 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  37.64 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  39.33 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  38.02 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  37.15 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  35.55 
 
 		 349 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  37.15 
 
 		 343 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  36.68 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  37.54 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  35.31 
 
 		 365 aa  192  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  37.39 
 
 		 361 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  35.77 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  37.22 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  39.38 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  36.92 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  36.86 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  38.48 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  36.96 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  37.46 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  37.33 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  36.13 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  38.42 
 
 		 343 aa  186  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  37.6 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  37.5 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  37.5 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  37.5 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  34.92 
 
 		 363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  34.07 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  38.2 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  36.44 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  33.89 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  36.39 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  35.11 
 
 		 368 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  35.16 
 
 		 322 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  36.69 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  36.47 
 
 		 341 aa  179  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  35 
 
 		 362 aa  179  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  36.89 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  38.33 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  32.4 
 
 		 366 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  33.05 
 
 		 372 aa  176  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  36 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  32.94 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  34.48 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  32.87 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  34.04 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3044  6-phosphofructokinase  37.06 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  32.12 
 
 		 365 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  34.68 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  34.07 
 
 		 359 aa  172  7.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  33.52 
 
 		 323 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  33.99 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  35.98 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  33.14 
 
 		 323 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  34.68 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  31.65 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  31.65 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  33.99 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  33.84 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  34.09 
 
 		 320 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  35.42 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  35.24 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  33.24 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  32.68 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  34.46 
 
 		 344 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  32.7 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  33.89 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  32.58 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 		 319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  35.16 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0642  6-phosphofructokinase  31.67 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  34.46 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  30.64 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  31.61 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>