More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2820 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  99.23 
 
 		 390 aa  789    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  100 
 
 		 390 aa  794    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  67.1 
 
 		 385 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  66.84 
 
 		 385 aa  528  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0376  6-phosphofructokinase  58.51 
 
 		 390 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0616  6-phosphofructokinase  57.7 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.675369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1623  6-phosphofructokinase  46.82 
 
 		 399 aa  362  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3015  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  48.56 
 
 		 366 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  47 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0911  6-phosphofructokinase  46.35 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2085  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  47.19 
 
 		 394 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1792  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  47.33 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1871  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  47.33 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.444059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1732  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  45.76 
 
 		 394 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  38.11 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  38.29 
 
 		 341 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  36.14 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  36.86 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  36.49 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  37.43 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  35.5 
 
 		 344 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  36.51 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  36.17 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  37.22 
 
 		 342 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  38.24 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  36.31 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  36.22 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  36.86 
 
 		 342 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  37.1 
 
 		 341 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  36.49 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  34.99 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  34.08 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  37.54 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  37.24 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  35.95 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  35.76 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  32.95 
 
 		 340 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  33.52 
 
 		 363 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  34.15 
 
 		 343 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  33.52 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  35.33 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  33.61 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  34.88 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  33.15 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  33.8 
 
 		 340 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  33.52 
 
 		 341 aa  186  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  33.24 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  34.16 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  33.16 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  30.59 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  34.23 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  32.97 
 
 		 345 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  34.17 
 
 		 351 aa  183  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  34.86 
 
 		 342 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  33.7 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  33.7 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  33.43 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  33.9 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  31 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  32.08 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  34.29 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  34.47 
 
 		 363 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  33.52 
 
 		 356 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  34.05 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  32.6 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  32.16 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  33.51 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  33.7 
 
 		 336 aa  173  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  34.88 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  33.81 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  30.83 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  31.91 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  32.24 
 
 		 358 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  30.97 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  30.56 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  31.62 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2794  6-phosphofructokinase  29.81 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  32.51 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  31.04 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  31.11 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  30.6 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  31.9 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  31.71 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  29.73 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  30.6 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  28.8 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  28.8 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  31.86 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  32.43 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  32.43 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  32.43 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  30.08 
 
 		 332 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  31.17 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  31.84 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  28.84 
 
 		 320 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  29.54 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  29.62 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  32.86 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  29.62 
 
 		 322 aa  156  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>