More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3375 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3375  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 
602 aa  1236    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.206133 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1007  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  47.31 
 
 
562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.124687 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1550  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  43.61 
 
 
560 aa  433  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0163  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  42.03 
 
 
549 aa  392  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0020  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  43.47 
 
 
555 aa  392  1e-107  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0477  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  41.03 
 
 
553 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.680887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1694  phosphofructokinase  35.32 
 
 
702 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256037  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0479  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  38.51 
 
 
548 aa  319  7.999999999999999e-86  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.736069  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0648  6-phosphofructokinase  26.74 
 
 
419 aa  128  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0623  6-phosphofructokinase  26.51 
 
 
419 aa  126  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1743  6-phosphofructokinase  25 
 
 
416 aa  120  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  30 
 
 
321 aa  93.6  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  31.56 
 
 
321 aa  91.7  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  28.62 
 
 
320 aa  90.9  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  30 
 
 
319 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  30 
 
 
319 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2276  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  22.54 
 
 
445 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.719856  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.74 
 
 
444 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  28.22 
 
 
343 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  28.22 
 
 
343 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
343 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  28.22 
 
 
343 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  30.04 
 
 
322 aa  87.4  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  29.88 
 
 
343 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2702  6-phosphofructokinase  32.85 
 
 
747 aa  87.4  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2734  6-phosphofructokinase  29.25 
 
 
741 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  31.95 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  29.35 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  29.84 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  32.41 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  28.22 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.28 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  29.84 
 
 
341 aa  84  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  30.54 
 
 
324 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  25.51 
 
 
319 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  29.86 
 
 
328 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  29.88 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  30.37 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  30.2 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.98 
 
 
439 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3024  6-phosphofructokinase  29.88 
 
 
328 aa  82.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  31.69 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  27.53 
 
 
324 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  29.32 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  34.25 
 
 
363 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  30.17 
 
 
323 aa  82  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  30.77 
 
 
344 aa  82  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  28.93 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  27.76 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  31.12 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  27.5 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  30.65 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  32.37 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  29.55 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.39 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  32.37 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.88 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl174  6-phosphofructokinase  30.93 
 
 
323 aa  79.7  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  30.42 
 
 
340 aa  80.1  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4126  6-phosphofructokinase  31.3 
 
 
327 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  29.05 
 
 
319 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 
326 aa  80.1  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1875  6-phosphofructokinase  29.34 
 
 
744 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.507324  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0088  6-phosphofructokinase  31.3 
 
 
327 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  29.05 
 
 
319 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0089  6-phosphofructokinase  31.3 
 
 
327 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.45 
 
 
435 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  27.69 
 
 
319 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.12 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  29.89 
 
 
320 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  29.88 
 
 
341 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  29.5 
 
 
331 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  30.42 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  29.25 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.46 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  29.12 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  30.86 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  26.38 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  30.04 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  29.92 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  28.68 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  29.64 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  29.37 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  29.46 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  29.88 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  26.78 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  27.98 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  32.81 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  29.49 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  30.83 
 
 
320 aa  77  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  28.93 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>