More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0477 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0477  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 
553 aa  1143    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.680887  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1550  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  43.6 
 
 
560 aa  423  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0163  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  39.71 
 
 
549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1007  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  39.21 
 
 
562 aa  396  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.124687 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0020  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  39.81 
 
 
555 aa  382  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3375  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  41.03 
 
 
602 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.206133 
 
 
-
 
NC_002620  TC0479  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  39.71 
 
 
548 aa  350  5e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.736069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1694  phosphofructokinase  35.62 
 
 
702 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1743  6-phosphofructokinase  26.79 
 
 
416 aa  111  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0623  6-phosphofructokinase  25.83 
 
 
419 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0648  6-phosphofructokinase  25.83 
 
 
419 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0426805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  25.73 
 
 
344 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  26.46 
 
 
440 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  22.46 
 
 
445 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2276  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  25.06 
 
 
445 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.719856  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  23.28 
 
 
342 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.24 
 
 
429 aa  92.8  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25 
 
 
445 aa  90.9  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  27.95 
 
 
321 aa  90.5  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.34 
 
 
439 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  25.53 
 
 
341 aa  87  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  24.72 
 
 
343 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  24.72 
 
 
343 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  24.72 
 
 
343 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  30.42 
 
 
328 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.06 
 
 
461 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.46 
 
 
346 aa  86.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  30.04 
 
 
343 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  24.54 
 
 
341 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  27.86 
 
 
341 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  23.87 
 
 
345 aa  86.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  27.76 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  25.26 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  24.31 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  25.99 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.02 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  28.05 
 
 
343 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  25.52 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  29.53 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30 
 
 
439 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  29.15 
 
 
336 aa  82.8  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  23.83 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  26.05 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  26.67 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  24.34 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.25 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  30.66 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  30.14 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  27.8 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.71 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  28.08 
 
 
322 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  27.41 
 
 
319 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  27.41 
 
 
319 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  28.17 
 
 
365 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  25.19 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.53 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  24.08 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  29.8 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  25.99 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  27.16 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  27.41 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  28.51 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  26.75 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  27.95 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.27 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  28.77 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  25.1 
 
 
319 aa  77  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  27.41 
 
 
320 aa  77  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  27.06 
 
 
322 aa  77  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  27.87 
 
 
319 aa  77  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  28.68 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  26.64 
 
 
322 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  27.57 
 
 
345 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  26.56 
 
 
320 aa  76.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  27.86 
 
 
341 aa  76.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  29.96 
 
 
319 aa  76.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  26.53 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  27.56 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  28.69 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  28.17 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  28.92 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.93 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  27.46 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  26.54 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  28.21 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2592  6-phosphofructokinase  30.05 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0556  6-phosphofructokinase  26.45 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0367843  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  28.19 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.29 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  27.5 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.89 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  28.03 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0088  6-phosphofructokinase  28.68 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4126  6-phosphofructokinase  28.68 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  26.34 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  25.62 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0336  6-phosphofructokinase  28.22 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0089  6-phosphofructokinase  28.68 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  28.33 
 
 
320 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>