279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0479 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0479  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 
548 aa  1127    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.736069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1550  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  42.7 
 
 
560 aa  458  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0163  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  40.07 
 
 
549 aa  419  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1007  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  38.36 
 
 
562 aa  397  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.124687 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0020  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  39.13 
 
 
555 aa  377  1e-103  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0477  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  39.71 
 
 
553 aa  350  5e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.680887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3375  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  38.51 
 
 
602 aa  319  7e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.206133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1694  phosphofructokinase  36.44 
 
 
702 aa  224  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1743  6-phosphofructokinase  24.76 
 
 
416 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0648  6-phosphofructokinase  25.68 
 
 
419 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0623  6-phosphofructokinase  25.68 
 
 
419 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  28.52 
 
 
365 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  27.91 
 
 
321 aa  89.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  24.35 
 
 
346 aa  87  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.96 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  27.86 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  29.17 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  29.67 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0220  6-phosphofructokinase  30.17 
 
 
326 aa  82  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  25.71 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  27.08 
 
 
322 aa  80.1  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  23.62 
 
 
340 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  28.22 
 
 
319 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  28.22 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  26.83 
 
 
327 aa  77  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  25 
 
 
360 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  26.56 
 
 
319 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  27.32 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0556  6-phosphofructokinase  26.56 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0367843  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  29.68 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  31.02 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  25.31 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl174  6-phosphofructokinase  30.17 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  31.55 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0927  6-phosphofructokinase  27.08 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.729181  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  25 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  24.9 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  31.02 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  26.63 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  25.2 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  31.55 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  27.76 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  25.83 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  25.79 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  23.17 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  24.38 
 
 
322 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  27.05 
 
 
335 aa  73.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  23.85 
 
 
368 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  25.71 
 
 
322 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  25.2 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0879  6-phosphofructokinase  23.33 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  24.79 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  26.53 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  27.5 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  23.44 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  26.44 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4126  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 
327 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0088  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  28.76 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  24.39 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  31.02 
 
 
331 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1755  6-phosphofructokinase  24.79 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2276  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  22.97 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.719856  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0089  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  29.05 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  27.83 
 
 
375 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  27.59 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  27.94 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  23.14 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  25.21 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  27.6 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  27.6 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  27.6 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2022  6-phosphofructokinase  23.58 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.761403  normal  0.299205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  27.6 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  27.6 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  27.6 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  27.6 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  27.6 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  27.6 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3102  6-phosphofructokinase  24.75 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000237495  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  28.63 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  24.93 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  29.95 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>