292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1694 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1694  phosphofructokinase  100 
 
 		 702 aa  1461    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3375  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  35.32 
 
 		 602 aa  320  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.206133 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1550  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  36.66 
 
 		 560 aa  293  6e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1007  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  34.77 
 
 		 562 aa  277  5e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.124687 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0020  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  38.54 
 
 		 555 aa  274  3e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0163  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  35.78 
 
 		 549 aa  273  8.000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0477  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  35.62 
 
 		 553 aa  235  3e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.680887  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0479  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  36.44 
 
 		 548 aa  224  6e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.736069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1743  6-phosphofructokinase  29.52 
 
 		 416 aa  101  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0648  6-phosphofructokinase  29.04 
 
 		 419 aa  97.8  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0623  6-phosphofructokinase  29.82 
 
 		 419 aa  97.8  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  33.78 
 
 		 359 aa  87  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  29.91 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  27.34 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  31.34 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  31.55 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  33.65 
 
 		 439 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  29.86 
 
 		 341 aa  76.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  28.22 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  27.82 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.31 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  31.25 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  30.49 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  28.1 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  29.95 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  28.25 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  30.37 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.72 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  28.14 
 
 		 322 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0336  6-phosphofructokinase  27.72 
 
 		 341 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  30.58 
 
 		 342 aa  73.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  28.22 
 
 		 368 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  28.96 
 
 		 341 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  33.33 
 
 		 340 aa  73.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  26.32 
 
 		 324 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  31.78 
 
 		 346 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  31.43 
 
 		 327 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  30.62 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2276  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  33.16 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.719856  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  30.14 
 
 		 341 aa  72  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  30.18 
 
 		 370 aa  72  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0220  6-phosphofructokinase  29.72 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  29.95 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  28.21 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  29.81 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  30.41 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  28.11 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  30.18 
 
 		 341 aa  70.1  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  27.68 
 
 		 336 aa  70.1  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19500  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.57 
 
 		 406 aa  70.5  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  25.75 
 
 		 319 aa  70.1  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.37 
 
 		 439 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  29.38 
 
 		 319 aa  69.7  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  31.07 
 
 		 336 aa  69.7  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  31.58 
 
 		 319 aa  69.7  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  33.94 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  27.7 
 
 		 319 aa  69.7  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  31.22 
 
 		 342 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  28.38 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  29.6 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1760  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.5 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.832765 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  27.7 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  29.65 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.4 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  29.03 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  29.03 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  29.03 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  29.91 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  30.32 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  30.95 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0642  6-phosphofructokinase  29.76 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  30.57 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  29.24 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  30.37 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  29.2 
 
 		 319 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  29.86 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.44 
 
 		 437 aa  67  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2597  6-phosphofructokinase  28.51 
 
 		 344 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0115361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  26.95 
 
 		 361 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  28.29 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0171  6-phosphofructokinase  29.23 
 
 		 320 aa  66.2  0.000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  28.64 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 320 aa  66.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  30.1 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4146  6-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  29.47 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50424  phosphofructokinase  30.15 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  29.33 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  29.47 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2022  6-phosphofructokinase  28.84 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.761403  normal  0.299205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0681  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.86 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2106  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.56 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.247023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3098  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.14 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>