More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1760 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0681  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  89.22 
 
 
401 aa  723    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.549272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1760  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 
401 aa  810    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.832765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2106  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  68.59 
 
 
404 aa  564  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.247023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2869  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  69.85 
 
 
403 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2609  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  68.09 
 
 
403 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619674  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2909  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  66.08 
 
 
404 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3098  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  65.34 
 
 
408 aa  534  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2066  phosphofructokinase  64.91 
 
 
406 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  64.25 
 
 
418 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0150  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  65.74 
 
 
413 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1999  phosphofructokinase  62.91 
 
 
408 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0150805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1905  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  62.91 
 
 
408 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0322067  hitchhiker  0.000281124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15800  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  63.07 
 
 
407 aa  498  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1438  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  63.32 
 
 
399 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19500  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  57.29 
 
 
406 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_55126  PFP pyrophosphate dependent phosphofructokinase  48.15 
 
 
418 aa  359  5e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.82 
 
 
439 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  29.73 
 
 
341 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.12 
 
 
445 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  32.02 
 
 
343 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  30.36 
 
 
440 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.36 
 
 
445 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  29.82 
 
 
342 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.75 
 
 
439 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  29.94 
 
 
342 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  29.52 
 
 
341 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  28.87 
 
 
341 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  27.25 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.41 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.57 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  30.86 
 
 
365 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.21 
 
 
461 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  28.99 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  29.22 
 
 
346 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  29.97 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  28.61 
 
 
342 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  24.75 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  29.61 
 
 
344 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  30.11 
 
 
366 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  27.54 
 
 
348 aa  96.3  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  29.22 
 
 
342 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  29.04 
 
 
341 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  28.19 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.75 
 
 
429 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  28.08 
 
 
360 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  29.86 
 
 
341 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  23.82 
 
 
437 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  25.71 
 
 
407 aa  93.2  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  27.25 
 
 
319 aa  93.2  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  27.49 
 
 
344 aa  93.2  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  29.22 
 
 
344 aa  92.8  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  29.19 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.53 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  28.09 
 
 
322 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25 
 
 
429 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  28.44 
 
 
341 aa  90.5  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  28.01 
 
 
343 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  29.13 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  27.9 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  28.7 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  29.33 
 
 
319 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2085  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  27.51 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  27.57 
 
 
385 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.25 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  30.36 
 
 
336 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  27.86 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  27.86 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  27.86 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  27.57 
 
 
385 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  27.3 
 
 
359 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  27.53 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1792  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.51 
 
 
394 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1871  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.51 
 
 
394 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.444059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0376  6-phosphofructokinase  26.96 
 
 
390 aa  86.7  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.18 
 
 
435 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  27.97 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  26.26 
 
 
326 aa  85.9  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  27.79 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  27.81 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  28.73 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  27.3 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  29.9 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  27.73 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  27.73 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  27.67 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  28.84 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  26.67 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  29.04 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.97 
 
 
448 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  27.27 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  28.3 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  24.53 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.59 
 
 
450 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  27.37 
 
 
343 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  27.54 
 
 
321 aa  82.8  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  25.97 
 
 
365 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  25.29 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  27.45 
 
 
319 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  25.46 
 
 
324 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>